More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1247 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  100 
 
 		 280 aa  570  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  36.92 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  36.33 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  39.91 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  34.81 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  36.25 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  34.29 
 
 		 283 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.14 
 
 		 283 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.73 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  35.14 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  34.36 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.36 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.75 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  33.98 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.98 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  33.98 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  33.98 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  35.98 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  33.98 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  33.98 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  32.44 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  36.17 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  35.83 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  33.21 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  31.34 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  33.85 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  34.19 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  34.24 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  33.96 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  35.5 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  38.1 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  33.46 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.25 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  32.94 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  33.08 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  33.74 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  33.08 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  32.69 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  32.1 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  32.08 
 
 		 283 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  33.03 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  34.84 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.1 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  37.33 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  32.82 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  32.96 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  35.38 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  33.83 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  36.65 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.08 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  35.4 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  34.21 
 
 		 325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  32.33 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  32.62 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  35.83 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  34.43 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  33.73 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  32.36 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  33.47 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  30.56 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.42 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  34.96 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  33.94 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  32.35 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  36.99 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.36 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.32 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  37.44 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  34.14 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  33.8 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  33.7 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  30.86 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  33 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  37.5 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  30.59 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  33.77 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.4 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  31.54 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  33.19 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  32.78 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  34.42 
 
 		 291 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  31.54 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  32.2 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  33.91 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.65 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.55 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  33.81 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  32.86 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  30.15 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  35.22 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  33.46 
 
 		 587 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0895  HemK family modification methylase  32.51 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00424484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  28.99 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  33.46 
 
 		 587 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  34.88 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.91 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  35.32 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.33 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000102093  hitchhiker  0.0000000000956396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>