More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6637 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6637  methylase  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  52.09 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  49.54 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  45.58 
 
 		 231 aa  158  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  43.4 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2307  methylase  50.24 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000535165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  42.38 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  42.51 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  42.92 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  42.92 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  40.28 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  40.29 
 
 		 236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  33.14 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  32.75 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  32.16 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.43 
 
 		 280 aa  89  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  31.58 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  32.21 
 
 		 302 aa  85.9  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  32.75 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.49 
 
 		 277 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  35 
 
 		 285 aa  84.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.61 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.91 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.49 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.49 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.49 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.49 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.58 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  37.58 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  31.98 
 
 		 284 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.94 
 
 		 277 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  36.94 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  39.47 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.31 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  37.14 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.1 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  35.29 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  36.98 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  38.51 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1555  methyltransferase small  36.57 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  39.47 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  31.75 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  37.16 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  40.76 
 
 		 276 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  37.84 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.95 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  36.97 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  37.16 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  37.84 
 
 		 284 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  37.16 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  35.67 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.67 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  32.95 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  36.49 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.67 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.67 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  34.54 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.67 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  36.49 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  40.76 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.88 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  36.08 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  36.48 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  47.32 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  30.57 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  37.04 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.57 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.9 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.545999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  36.31 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.7 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.42 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  35.93 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  34.15 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  33.16 
 
 		 277 aa  75.1  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  32.08 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  31.37 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  30.57 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.5 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  40.27 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  37.11 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  26.11 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  43.2 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  35.4 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  33.16 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  38.02 
 
 		 536 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  32.31 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  33.54 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  39.49 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  36.41 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  29.14 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  33.76 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  39.6 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  36.49 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  38.85 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  49.04 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  36.49 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  36.49 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.65 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  36.49 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>