More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1555 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1555  methyltransferase small  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  40 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.86 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  32.07 
 
 
288 aa  72  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  35.17 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  32.65 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0847  methyltransferase small  29.47 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  31.17 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  37.74 
 
 
280 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  37.74 
 
 
280 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  40.16 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  30.67 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  33.33 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.21 
 
 
283 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  35.58 
 
 
307 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  25.9 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  38.76 
 
 
311 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  33.78 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.42 
 
 
295 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.34 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  32.75 
 
 
285 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  28.22 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  37.76 
 
 
282 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  35.37 
 
 
317 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  38.03 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.81 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  39.69 
 
 
282 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  36.71 
 
 
280 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  30.59 
 
 
231 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  32 
 
 
283 aa  62  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  37.36 
 
 
286 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  40 
 
 
289 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0822  modification methylase, HemK family  36.52 
 
 
284 aa  62  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  33.56 
 
 
299 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  37.86 
 
 
295 aa  62  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.58 
 
 
280 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  36.52 
 
 
317 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  31.64 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  38.85 
 
 
274 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.99 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  37.84 
 
 
280 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  37.58 
 
 
280 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  31.55 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  28.83 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.87 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  31.09 
 
 
359 aa  60.5  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  38.03 
 
 
283 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  31.01 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  27.03 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  38.89 
 
 
275 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  26.67 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2594  modification methylase, HemK family  39.02 
 
 
310 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  30.46 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.78 
 
 
280 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2160  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.33 
 
 
314 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.971286 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  34.67 
 
 
297 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  32.81 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.28 
 
 
289 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  36.61 
 
 
299 aa  59.3  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6637  methylase  34.86 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  30.73 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.1 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.08 
 
 
280 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  30.14 
 
 
185 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3080  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.34 
 
 
305 aa  58.2  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  31.74 
 
 
284 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.42 
 
 
307 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220826  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  30 
 
 
285 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  30.32 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  37.29 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  34.57 
 
 
285 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  39.47 
 
 
281 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  40.48 
 
 
288 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  30.71 
 
 
280 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1415  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.33 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.270918  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1480  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.33 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.760634  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1468  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.33 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0806  modification methylase, HemK family  27.74 
 
 
282 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.405188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  42.17 
 
 
301 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  36.62 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  32.76 
 
 
317 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  34.59 
 
 
270 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  35.16 
 
 
296 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2013  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.42 
 
 
307 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  36.8 
 
 
281 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  30.97 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  34.11 
 
 
287 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  26.67 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  48.1 
 
 
288 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
297 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0701  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.21 
 
 
321 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  30.46 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1540  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30 
 
 
309 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  35.11 
 
 
273 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  38.26 
 
 
278 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  39.02 
 
 
294 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1993  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.26 
 
 
296 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  29.02 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  25.68 
 
 
185 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>