More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  100 
 
 		 218 aa  417  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  55.5 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  52.78 
 
 		 231 aa  184  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6637  methylase  51.16 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2307  methylase  56.54 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000535165  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  45.79 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  46.45 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  46.26 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  46.26 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  51.17 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  46.58 
 
 		 249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  41.51 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  32.74 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  33.33 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  31.95 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  30.94 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  30.95 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  37.79 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  35.23 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  26.34 
 
 		 177 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  31.03 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  28.87 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  30.21 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  33.9 
 
 		 578 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  34.83 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  34.27 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1555  methyltransferase small  31.64 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  32.54 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.65 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  34.43 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  43.93 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  28.65 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  39.17 
 
 		 536 aa  66.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  36.97 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  28.48 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  37 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  32.2 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.61 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  32.9 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  32.29 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  32.07 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  37.34 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  29.91 
 
 		 262 aa  62  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  38.37 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0569  modification methylase, HemK family  28.57 
 
 		 267 aa  62  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1427  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  34 
 
 		 306 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  37.84 
 
 		 283 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  31.09 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  26.42 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.8 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.545999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  36.24 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  31.51 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0303  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.69 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.86 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  40.4 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.78 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  31.77 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  40.4 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2812  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.78 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.21 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  36.79 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  37.86 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  40.4 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  36.61 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  40.4 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.26 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  36.45 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0822  HemK family modification methylase  25.24 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.21973  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  45.37 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  35.85 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1353  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.57 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  36.18 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  31.87 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  36.84 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  33 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  33.14 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  32.32 
 
 		 359 aa  58.5  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  39.18 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.27 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  32.56 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  32.56 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  44.23 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  31.79 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  42.67 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1344  modification methylase, HemK family  30.4 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  36.42 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2878  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.37 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123822  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  39.18 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.37 
 
 		 313 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  37.96 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  36.18 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  34.48 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  42.67 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  38.14 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  43.14 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  38.14 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  26.32 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  22.83 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>