More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2307 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2307  methylase  100 
 
 		 218 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000535165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  56.54 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  57.67 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  50.7 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  47.91 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  49.33 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  47.42 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6637  methylase  49.29 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  50.23 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  47.44 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  47.44 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  50.46 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  34.66 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  29.61 
 
 		 202 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  29.61 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  29.05 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  29.61 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.83 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  41.18 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  40.52 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  39.57 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.87 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  30.65 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  34.88 
 
 		 185 aa  72  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.5 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  41.5 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  41.1 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  38.56 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.25 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  31.61 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  35.29 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  32.37 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  30.05 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.67 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  32.08 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.14 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  28.42 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  38.1 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  37.29 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  32.12 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  36.18 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  35.81 
 
 		 284 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  25.82 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  33.89 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.88 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02756  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.36 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0268586  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.77 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  35.98 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  36.69 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.86 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  25.67 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  35.14 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.22 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  32.75 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  34.46 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1569  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.13 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  34.46 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  36.26 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  34.46 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  34.46 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  36.41 
 
 		 274 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  40.52 
 
 		 382 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.34 
 
 		 277 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.61 
 
 		 297 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  33.11 
 
 		 286 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  32.97 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.46 
 
 		 343 aa  61.6  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.52 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  36.13 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.83 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  33.11 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  33.11 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.83 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.83 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.34 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0701  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.66 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.46 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.59 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  33.9 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.51 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  36.55 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  34.21 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2252  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2223  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.26 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.53 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  38.85 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  32.64 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  32.77 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.71 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  38.28 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  33.51 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  33.77 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  36.24 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.45 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.05 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  32.28 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2812  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1270  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.2 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>