More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0279 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  100 
 
 
185 aa  370  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  53.85 
 
 
188 aa  187  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  52.17 
 
 
185 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  45.99 
 
 
202 aa  160  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  49.73 
 
 
188 aa  155  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  47.25 
 
 
193 aa  154  9e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  45.25 
 
 
208 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  45.41 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  43.02 
 
 
204 aa  143  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  44.39 
 
 
193 aa  132  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  40.49 
 
 
202 aa  131  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  43.53 
 
 
164 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  46.2 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  36.51 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  36.56 
 
 
202 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  37.97 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  35.83 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  36.02 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  31.91 
 
 
177 aa  97.1  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  32 
 
 
178 aa  95.1  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  35.33 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  30.45 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  28.57 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  28.65 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  28.81 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  34.87 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.73 
 
 
288 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  33.13 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.48 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.92 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  34.57 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  29.79 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  28.73 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  31.61 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5532  predicted protein  31.72 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  31.15 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  32.57 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  31.45 
 
 
278 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  32.9 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  27.68 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1394  hypothetical protein  28.02 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  28.98 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  33.52 
 
 
414 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  34.87 
 
 
378 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  35.06 
 
 
336 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  32.4 
 
 
261 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  31.77 
 
 
223 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  33.91 
 
 
278 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30 
 
 
279 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  28.77 
 
 
230 aa  62  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  28.81 
 
 
262 aa  61.6  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.73 
 
 
277 aa  61.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  32.82 
 
 
283 aa  61.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  34 
 
 
345 aa  61.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  32.39 
 
 
293 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
292 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  28 
 
 
280 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02104  conserved hypothetical protein  26.51 
 
 
264 aa  60.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.563309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  32.37 
 
 
280 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  31.41 
 
 
287 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  35.33 
 
 
325 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1925  hypothetical protein  26.29 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.235026  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  32.95 
 
 
291 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  29.05 
 
 
275 aa  60.5  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  30.18 
 
 
286 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  31.79 
 
 
278 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  33.12 
 
 
274 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  29.61 
 
 
272 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0945  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  58.9  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  33.14 
 
 
218 aa  58.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  25.79 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0569  modification methylase, HemK family  30.71 
 
 
267 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  31.61 
 
 
276 aa  58.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  30.3 
 
 
286 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  29.82 
 
 
278 aa  58.2  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  29.17 
 
 
276 aa  57.8  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  31.61 
 
 
276 aa  57.8  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  28.12 
 
 
289 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.12 
 
 
286 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  36.88 
 
 
317 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  32.81 
 
 
284 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  32.47 
 
 
257 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  31.79 
 
 
280 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  35.19 
 
 
262 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.34 
 
 
283 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  30.47 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  45.95 
 
 
317 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  33.33 
 
 
317 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.88 
 
 
283 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  28.92 
 
 
275 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1555  methyltransferase small  25.68 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  32.19 
 
 
287 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  31.48 
 
 
287 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0859  hypothetical protein  32.14 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  28.88 
 
 
297 aa  55.1  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 
261 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.01 
 
 
289 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0806  modification methylase, HemK family  30.61 
 
 
282 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.405188  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.61 
 
 
291 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  27.53 
 
 
279 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>