106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1380 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  100 
 
 		 178 aa  359  1e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  32 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  30.43 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  30.68 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  31.84 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  27.27 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  30.98 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  26.7 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  30.69 
 
 		 202 aa  72  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  30.73 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  26.99 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  27.17 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  28.73 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  27.07 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  29.83 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1394  hypothetical protein  28.4 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  25.15 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0859  hypothetical protein  28.24 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  26.74 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0945  hypothetical protein  27.11 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1925  hypothetical protein  26.74 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.235026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  29.31 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  23.78 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  23.91 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.9 
 
 		 289 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  24.1 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  33.33 
 
 		 295 aa  50.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.14 
 
 		 295 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  26.76 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  31.94 
 
 		 271 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3613  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.42 
 
 		 325 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.283182  normal  0.0446464 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  28.42 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  26.38 
 
 		 286 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  28.57 
 
 		 292 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1993  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  24.68 
 
 		 296 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  25.29 
 
 		 257 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  34.19 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.78 
 
 		 299 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  26.97 
 
 		 277 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  27.05 
 
 		 316 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  29.03 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  29.84 
 
 		 291 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  22.54 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  21.16 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  26.76 
 
 		 317 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  25.5 
 
 		 286 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  25.5 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  28.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  25.83 
 
 		 276 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  29.03 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  26.76 
 
 		 326 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  25.53 
 
 		 379 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  25.35 
 
 		 317 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  31.46 
 
 		 280 aa  44.7  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  30.3 
 
 		 265 aa  44.7  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0855  modification methylase HemK  32.5 
 
 		 280 aa  44.3  0.0008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  30.59 
 
 		 255 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1918  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  28.37 
 
 		 361 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  26.9 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.01 
 
 		 306 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  19.39 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1063  HemK family modification methylase  30.83 
 
 		 280 aa  43.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  30.65 
 
 		 317 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  27.42 
 
 		 280 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  26.26 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2481  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  23.12 
 
 		 309 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.61 
 
 		 296 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.87 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  27.52 
 
 		 299 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  25 
 
 		 284 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  24.43 
 
 		 367 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25.2 
 
 		 343 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  25.52 
 
 		 288 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  28.7 
 
 		 275 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.02 
 
 		 322 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  28.57 
 
 		 279 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25.19 
 
 		 330 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  23.68 
 
 		 272 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  21.97 
 
 		 273 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  21.39 
 
 		 297 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0448  hypothetical protein  26.79 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000109098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2519  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  22.22 
 
 		 319 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724437 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  26.71 
 
 		 345 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  27.45 
 
 		 215 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  23.49 
 
 		 307 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  26.28 
 
 		 324 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  28.46 
 
 		 298 aa  42  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  32.43 
 
 		 262 aa  42  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  28.79 
 
 		 288 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  34.4 
 
 		 261 aa  41.6  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  27.54 
 
 		 299 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1427  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  24.64 
 
 		 306 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  30.92 
 
 		 359 aa  42  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.87 
 
 		 291 aa  41.6  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25.78 
 
 		 354 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1015  HemK family modification methylase  26.51 
 
 		 280 aa  41.2  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  28.21 
 
 		 317 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1042  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.520358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  30.16 
 
 		 278 aa  41.2  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  30.22 
 
 		 321 aa  41.2  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.521337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>