More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1724 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  100 
 
 		 278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2153  HemK family modification methylase  58.63 
 
 		 278 aa  329  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2191  HemK family modification methylase  58.63 
 
 		 278 aa  329  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.961515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.56 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  35.32 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  42.25 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  34.94 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.94 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  34.57 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  34.57 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  34.57 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  34.57 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.57 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.2 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.57 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  34.2 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  36.9 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  36.14 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  33.46 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  36.43 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  35.06 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  33.7 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  34.62 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  37.1 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  34.52 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  36.5 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  34.52 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  39.09 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  33.45 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.32 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  37.99 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  32.42 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  32.54 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  31.62 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  34.57 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  32.03 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  33.99 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  30.08 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.42 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  31.42 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.12 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  32.44 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  34.57 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1045  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.78 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  29.58 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  32.06 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  31.87 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  36.92 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  32.97 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  36.55 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  30.5 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  32.97 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  32.32 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.49 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  31.87 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  34.25 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.93 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  31.52 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  31.12 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  31.58 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.73 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.58 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.03 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  29.03 
 
 		 283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  27.21 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  29.77 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  33.71 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  31.05 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.42 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.64 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  31.06 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  32.67 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  33.85 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.54 
 
 		 283 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  28.96 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  31.06 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  30.66 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  30 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  34.78 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  31.02 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  29.89 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.33 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  33.08 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  32.45 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  33.47 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.64 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  29.91 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  31.1 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  27.17 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  30.97 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.94 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  31.44 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03421  putative protein methyltransferase  35.78 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.783711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  28.96 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  31.97 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  28.81 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  32.22 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  36.4 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>