More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4319 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 286 aa  594  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  57.34 
 
 		 282 aa  341  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  40.7 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  41.48 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  42.38 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  43.28 
 
 		 286 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  40.67 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  40.15 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  41.64 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  38.32 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  42.53 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  38.17 
 
 		 304 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  39.47 
 
 		 330 aa  149  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  37.99 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  39.66 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  40.35 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.96 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  35.93 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  38.13 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  38.16 
 
 		 277 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  32.22 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  35.29 
 
 		 361 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  34.44 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  36.4 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  39.42 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  35.32 
 
 		 262 aa  135  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  39.47 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  38.35 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.92 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  35.74 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  37.22 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  39.46 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  34.53 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.43 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  34.85 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  34.07 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.1 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.01 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  37.21 
 
 		 359 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.09 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  33.21 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2191  HemK family modification methylase  36.09 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.961515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2153  HemK family modification methylase  36.09 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.27 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.83 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.84 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  36.12 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  37.12 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  33.72 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  37.73 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.73 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  37.73 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32.91 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  34.34 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.72 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  35.11 
 
 		 587 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  35.11 
 
 		 587 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  38.98 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.6 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  38.12 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  37.73 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  37.73 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.73 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.73 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  34.33 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  36.93 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  37.27 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.59 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  37.27 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  32.96 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  35.56 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  37.13 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.62 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  35.37 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.96 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.56 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.09 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  34.21 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  34.91 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  34.18 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.74 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  35.68 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.71 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  30 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.8 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_002620  TC0293  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.09 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  36.6 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  35.93 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0042  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.62 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.24008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  39.17 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  36.56 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  32.09 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4934  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.77 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  35.22 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  34.02 
 
 		 285 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  34.76 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  35.24 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  35.32 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  35.11 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  32.77 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>