More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0616 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  100 
 
 
359 aa  703    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  46.61 
 
 
361 aa  316  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  40.23 
 
 
288 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  37.23 
 
 
301 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  35.5 
 
 
306 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  38 
 
 
286 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  38 
 
 
286 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  38 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  35.11 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  36.12 
 
 
286 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  38.89 
 
 
330 aa  172  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  37.16 
 
 
285 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.2 
 
 
297 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  39.38 
 
 
285 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  34.63 
 
 
284 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  36.78 
 
 
284 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  33.07 
 
 
289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  32.23 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  34.63 
 
 
280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  37.79 
 
 
262 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.72 
 
 
300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  32.47 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  34.5 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  36.78 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  38.06 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.57 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.57 
 
 
277 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  35.77 
 
 
282 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  39.75 
 
 
286 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  35.38 
 
 
282 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  35.38 
 
 
282 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  33.72 
 
 
300 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  32.75 
 
 
284 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.57 
 
 
277 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.57 
 
 
277 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.57 
 
 
277 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  35.25 
 
 
282 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  34.98 
 
 
287 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  33.57 
 
 
288 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  42.17 
 
 
271 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  32.14 
 
 
284 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  31.62 
 
 
274 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  32.75 
 
 
296 aa  160  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  33.22 
 
 
285 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  33.81 
 
 
284 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  31.27 
 
 
304 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  35.14 
 
 
285 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.43 
 
 
276 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  35.38 
 
 
280 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  35.69 
 
 
283 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  34.73 
 
 
287 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.68 
 
 
277 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.58 
 
 
281 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.45 
 
 
284 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  37.74 
 
 
277 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.04 
 
 
297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  34.19 
 
 
283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.19 
 
 
277 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  40.77 
 
 
276 aa  156  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  35.19 
 
 
277 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  38.21 
 
 
277 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.19 
 
 
277 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  35.19 
 
 
277 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.19 
 
 
277 aa  155  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.19 
 
 
277 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.19 
 
 
277 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.19 
 
 
277 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  37.69 
 
 
279 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  32.13 
 
 
275 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.27 
 
 
275 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  39.52 
 
 
276 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  34.56 
 
 
283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.56 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  34.56 
 
 
283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  34.62 
 
 
280 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.93 
 
 
283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.56 
 
 
283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  35 
 
 
280 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.07 
 
 
288 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  39.52 
 
 
276 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.57 
 
 
276 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  34.15 
 
 
287 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  38.57 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.56 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  36.84 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  34.56 
 
 
283 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  34.75 
 
 
302 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  32.97 
 
 
288 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  33.71 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.04 
 
 
276 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.14 
 
 
276 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.5 
 
 
276 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.57 
 
 
289 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.21 
 
 
283 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  33.82 
 
 
283 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  32.47 
 
 
285 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  36.32 
 
 
281 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.67 
 
 
281 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.29 
 
 
276 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.47 
 
 
285 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>