More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004444 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  100 
 
 		 215 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  77.21 
 
 		 239 aa  357  7e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  57.67 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  53.02 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  46.61 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  43.12 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  40.35 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  41.28 
 
 		 248 aa  161  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  41.28 
 
 		 248 aa  161  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  42.08 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  40.83 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  42.08 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  42.36 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  40.18 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  42.11 
 
 		 243 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  41.89 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  41.44 
 
 		 238 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  41.55 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.55 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  41.55 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  41.36 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  41.55 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  42.47 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  41.55 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  41.55 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  41.55 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  41.55 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  39.21 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  41.1 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  40.99 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  40.99 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  38.64 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  41.26 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  37.9 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  39.15 
 
 		 251 aa  148  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  38.67 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  40.45 
 
 		 245 aa  144  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  38.99 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  35.98 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  34.39 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  38 
 
 		 264 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  36.99 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  35.43 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  33.18 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  38.1 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  32.93 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 253 aa  121  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  34.39 
 
 		 238 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  33.61 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  32.47 
 
 		 248 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  33.48 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  33.9 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  27.94 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  26.39 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0866  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.08 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  23.56 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  25.7 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  35.63 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  28.22 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  35.63 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  25.46 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  32.72 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  29.65 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  27.17 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  29.1 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  26.27 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  27.42 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0822  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  26.13 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2812  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.56 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.56 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  21.67 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  19.68 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3080  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.67 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1637  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.45 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  24.48 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1468  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.67 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  27.81 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2160  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.44 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.971286 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  19.68 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  36.47 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1353  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.18 
 
 		 317 aa  62  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1850  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35 
 
 		 302 aa  62  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966602  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  29 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  22.89 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  25.87 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  22.54 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.47 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  27.97 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1415  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.78 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.270918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1480  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.78 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.760634  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2040  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  19.63 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1344  modification methylase, HemK family  34.88 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1719  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  40.22 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.44 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  29.14 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.82 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>