More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1299 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  58.23 
 
 
236 aa  287  9e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  55.32 
 
 
240 aa  278  7e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  43.83 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  38.89 
 
 
248 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  38.89 
 
 
252 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  38.89 
 
 
248 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  39.15 
 
 
248 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  40.76 
 
 
236 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  36.6 
 
 
248 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  35.9 
 
 
238 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  39.83 
 
 
248 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  40.17 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 
245 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  40 
 
 
245 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  40 
 
 
245 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  40 
 
 
245 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  40 
 
 
245 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  35.47 
 
 
234 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  40 
 
 
245 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  39.15 
 
 
245 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  39.57 
 
 
245 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  38.46 
 
 
260 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  36.67 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  35.17 
 
 
236 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  40.85 
 
 
245 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  34.75 
 
 
236 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  34.44 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  40.5 
 
 
255 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  35.04 
 
 
240 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  34.62 
 
 
239 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  32.23 
 
 
238 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  35.8 
 
 
243 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  34.23 
 
 
220 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  37.61 
 
 
234 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  34.16 
 
 
243 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  32.23 
 
 
238 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  37.08 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  31.82 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  31.82 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  33.06 
 
 
248 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  32.77 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  36.86 
 
 
253 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  32.51 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  30.8 
 
 
251 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  30.68 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  32.68 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  33.18 
 
 
215 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  30.3 
 
 
264 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  32.91 
 
 
247 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  25 
 
 
263 aa  82  0.000000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  25.82 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  29.67 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  28 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  26.54 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  30.35 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  27.04 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  22.83 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  27.93 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  28 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  22.94 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  22.53 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  22.53 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  25.67 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  24.14 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  22.53 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  22.53 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  22.53 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  28.77 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  22.78 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  21.98 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  21.98 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  22.78 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  22.78 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  22.1 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  23.56 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  23.56 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  22 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  24.02 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  27.34 
 
 
211 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.28 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  22.51 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  25.54 
 
 
245 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  22.49 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  27.27 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  23.28 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  26.75 
 
 
338 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  27.85 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  23.08 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  22.75 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  27.85 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  23.11 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  25 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  23.04 
 
 
249 aa  58.5  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  28.48 
 
 
253 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.85 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  26.39 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  31.65 
 
 
301 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>