More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1524 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  525  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  81.05 
 
 
254 aa  430  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  61.25 
 
 
243 aa  314  9e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  50.61 
 
 
246 aa  261  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  50.61 
 
 
246 aa  261  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  50.61 
 
 
246 aa  261  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  50.61 
 
 
246 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  50.61 
 
 
246 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  50.61 
 
 
246 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  50.61 
 
 
246 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  49.8 
 
 
246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  49.8 
 
 
246 aa  258  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  48.98 
 
 
246 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  48.57 
 
 
246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  49.2 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  48.97 
 
 
249 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  49.59 
 
 
251 aa  249  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  48.97 
 
 
249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  41.98 
 
 
241 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  41.98 
 
 
241 aa  211  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  39.09 
 
 
241 aa  198  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  41.49 
 
 
251 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  39.44 
 
 
248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  40.08 
 
 
256 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  36.93 
 
 
260 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  41.1 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  37.19 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  36.36 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  38.62 
 
 
338 aa  169  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  37.56 
 
 
220 aa  149  4e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  32.49 
 
 
251 aa  148  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  32.68 
 
 
262 aa  142  5e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  33.61 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  34.45 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  31.51 
 
 
330 aa  139  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  34.03 
 
 
246 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  30.77 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  33.47 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  31.98 
 
 
256 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  35.68 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  30.33 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  30.43 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  33.96 
 
 
240 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  30.24 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  30.93 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  31.22 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  30.04 
 
 
263 aa  115  5e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  29.49 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  30.42 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  27.92 
 
 
211 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  27.95 
 
 
237 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  28.44 
 
 
235 aa  95.1  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  27.2 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  28.77 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  27.19 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  28.7 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  30.21 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  26.91 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  26.27 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  26.09 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  27.19 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  25.57 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  24.5 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  25.88 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  24.42 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  31.47 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  25.11 
 
 
236 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  24.86 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  23.68 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  23.25 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  24.66 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  25.7 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  25.59 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  22.37 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  24.32 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  22.58 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  25.45 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  22.54 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  26.27 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  26.39 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  24.77 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  23.18 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  26.39 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  22.07 
 
 
238 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  25.63 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  20.56 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  26.95 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  22.47 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  26.06 
 
 
220 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_92293  predicted protein  25.93 
 
 
311 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  26.71 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  23.5 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  26.63 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  25 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  28.07 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  22.62 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  27.23 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  28.07 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  22.17 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  23.18 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>