More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3230 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  100 
 
 		 236 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  99.15 
 
 		 236 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  82.16 
 
 		 241 aa  411  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  74.09 
 
 		 220 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  63.18 
 
 		 238 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  59.24 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  58.65 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  58.23 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  58.23 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  52.59 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  53.09 
 
 		 243 aa  245  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  49.62 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  51.69 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  48.56 
 
 		 244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  50 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  45.66 
 
 		 265 aa  221  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  44.96 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  44.49 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  42.19 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.98 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  42.98 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  42.98 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  41.03 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  42.98 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  42.98 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  42.98 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  41.1 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  42.98 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  42.55 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  41.28 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  38.56 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  40.43 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  42.08 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  37.71 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  40.08 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  39.32 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  34.75 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  37.55 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  37.55 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  37.55 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  40.17 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  35.59 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  35.59 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  36.32 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  37.19 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  36.78 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  34.31 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  37.3 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  31.92 
 
 		 263 aa  118  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  30.86 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  29.32 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  31.03 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  31.51 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  30.82 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  26.89 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  30.82 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  30.82 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  30.82 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  30.82 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  30.82 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  30.82 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  30.82 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  30.82 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  24.66 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  22.77 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  27.89 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  22.48 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  22.05 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  27.74 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  24.89 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  23.31 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.65 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  27.62 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  24.4 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  22.17 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  24.38 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  29.65 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  23.48 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  27.32 
 
 		 271 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  25.13 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  25.44 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  23.48 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  24.86 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  23.48 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  27.87 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  25.57 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  27.81 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  22.22 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  26.01 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  24.04 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  33.98 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  23.6 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  24.31 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  22.11 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  25.64 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  24.55 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  28.38 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  29.37 
 
 		 381 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>