More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0045 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  40.33 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  38.66 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  36.4 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  38.59 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  38.17 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  37.34 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  35.98 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  39.15 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  38.68 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  38.68 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  38.68 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  39.09 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  38.43 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  38.68 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  38.68 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  38.68 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  38.27 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  38.27 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  39.34 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  37.13 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  34.32 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  38.68 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  33.61 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  33.2 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  33.47 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  38.68 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  36.33 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  38.98 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  31.65 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  31.65 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  32.49 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  32.22 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  37.44 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  37.08 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  32.64 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  38.98 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  31.72 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  32.51 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  32.11 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  36.45 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  32.1 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  33.04 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  35.03 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  35.48 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  30.43 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  29.87 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  29.37 
 
 		 330 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  32.51 
 
 		 260 aa  111  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  30.7 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  33.19 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  27.76 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  33.19 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  29.24 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  29.82 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  30.37 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  27.65 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  32.5 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  32.8 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  30.8 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  28.05 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  29.51 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  26.07 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  27.46 
 
 		 223 aa  96.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  23.24 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  32.91 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  28.33 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  30.22 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  33.62 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  30.54 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  30.96 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  27.14 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  27.43 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  29.96 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  29.96 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  29.96 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  31.88 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  28.51 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  30.96 
 
 		 250 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  29.31 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  29.49 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  28.64 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  30.15 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  30.4 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  28.95 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  27.54 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.29 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  28.29 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  28.29 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  28.29 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  28.29 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  28.29 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  31.18 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  29.41 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  28.29 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  29.88 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  24.43 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>