More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0923 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  100 
 
 		 230 aa  463  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  47.83 
 
 		 233 aa  231  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  47.39 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  47.39 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  42.92 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  41.48 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  41.74 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  42.79 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  38.94 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  39.91 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  30.37 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  31.31 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  25.56 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  26.51 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  29.36 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  27.91 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  25.58 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  26.98 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  25.33 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  27.44 
 
 		 256 aa  88.6  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  24.9 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  23.26 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  24.07 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  25.45 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  26.39 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  26.2 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  26.41 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  24.54 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  24.54 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  25.12 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  23.61 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  24.07 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  24.07 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  24.07 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  24.07 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  24.07 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  24.65 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  28.78 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  20.76 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  23.77 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  23.61 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  26.2 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  29.3 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  23.15 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  25 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  20.76 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  19.49 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  24.19 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 256 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  23.32 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  28.49 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  27.03 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  26.24 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  25.88 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  22.03 
 
 		 249 aa  72  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  23.32 
 
 		 263 aa  72  0.000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  21.76 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  21.53 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  25.42 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  23.72 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  22.83 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  24.58 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  25.42 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.09 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  20.72 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  25.53 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  20.2 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  24.42 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  21.13 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  21.86 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  33.71 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  25.55 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  22.01 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  23.76 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  21.37 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  22.27 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5273  hypothetical protein  30.58 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1146  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  27.27 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  36.36 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  24.02 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  36.36 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  22.12 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.88 
 
 		 331 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  21.37 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.27 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4712  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  26.99 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0865771  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3636  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.77 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3507  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.77 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  18.22 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  22.81 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.74 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0840  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.77 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  28.19 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.74 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  27.56 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  29.47 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  37.04 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  24.3 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  24.24 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  22.27 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>