213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1649 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  100 
 
 
223 aa  458  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  53 
 
 
217 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  46.48 
 
 
216 aa  205  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  48.36 
 
 
216 aa  205  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  40.29 
 
 
232 aa  142  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  30.96 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  32.78 
 
 
246 aa  99  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  27.46 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  29.38 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  27.53 
 
 
246 aa  94.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  33.69 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  24.11 
 
 
246 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  31.14 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  23.66 
 
 
246 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  24.55 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  26.9 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  24.55 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  24.55 
 
 
246 aa  92  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  24.55 
 
 
246 aa  92  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  24.55 
 
 
246 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  30.17 
 
 
256 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  24.55 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  24.55 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  23.66 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  29.05 
 
 
256 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  29.55 
 
 
258 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  28.79 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  28.57 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  27.52 
 
 
255 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  30.17 
 
 
258 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  25.56 
 
 
249 aa  85.1  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  27.68 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  25.84 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  28.34 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  25.84 
 
 
249 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  30.59 
 
 
249 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  28.49 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  29.82 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  25.76 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  26.88 
 
 
245 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  25.25 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  26.42 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  26.86 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  25.27 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  25 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  27.78 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  27.78 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  23.01 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  23.79 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  23.79 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  28.98 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  28.81 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  28.49 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  27.27 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  24.44 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  31.64 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  26.15 
 
 
330 aa  62.4  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  20.56 
 
 
254 aa  61.6  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  29.78 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  28.25 
 
 
237 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  30.15 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  25.5 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  25 
 
 
252 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  25.3 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  23.19 
 
 
234 aa  55.1  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  24.26 
 
 
256 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  22.29 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  20.43 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  22.63 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  25.68 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  26.14 
 
 
235 aa  52.8  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  24.1 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  23.08 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  24.55 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0254  hypothetical protein  24.08 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0584  hypothetical protein  25.95 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13423  normal  0.0805665 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  20.22 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1334  hypothetical protein  24.43 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.303504  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  22.22 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0650  hypothetical protein  25.37 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.348415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  20.96 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  29.61 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  22.4 
 
 
253 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1910  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.14 
 
 
420 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1176  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.9 
 
 
395 aa  49.3  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  25 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  27.52 
 
 
253 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  24.05 
 
 
256 aa  48.5  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1487  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.82 
 
 
424 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  23.08 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  25.17 
 
 
257 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  23.39 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  29.59 
 
 
247 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2466  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.7 
 
 
426 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  22.76 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  32.61 
 
 
285 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.79 
 
 
309 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  26.32 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  33.78 
 
 
877 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0204163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>