225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0999 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  100 
 
 
240 aa  494  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  55.32 
 
 
235 aa  278  7e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  56.12 
 
 
236 aa  268  4e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  43.64 
 
 
239 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  42.19 
 
 
236 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  39.48 
 
 
248 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  39.48 
 
 
248 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  39.48 
 
 
252 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  41.77 
 
 
236 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  41.81 
 
 
245 aa  175  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  41.81 
 
 
245 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.81 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  41.81 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  41.81 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  41.81 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  41.81 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  41.81 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  39.66 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  40.52 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  40.59 
 
 
240 aa  172  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  37.61 
 
 
248 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  41.38 
 
 
245 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  42.24 
 
 
248 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  41.32 
 
 
241 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  39.39 
 
 
234 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  38.2 
 
 
240 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  38.91 
 
 
265 aa  164  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  38.03 
 
 
236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  41.38 
 
 
245 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  37.34 
 
 
239 aa  161  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  39.68 
 
 
243 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  37.86 
 
 
244 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  37.8 
 
 
251 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  37.5 
 
 
238 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  37.59 
 
 
264 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  37.82 
 
 
238 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  37.82 
 
 
234 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  37.6 
 
 
243 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  40.27 
 
 
220 aa  155  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  37.66 
 
 
238 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  36.67 
 
 
238 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  36.67 
 
 
238 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  39.83 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  35.69 
 
 
253 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  36.55 
 
 
247 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  36.32 
 
 
238 aa  145  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  34.7 
 
 
265 aa  142  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  35.08 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  35.66 
 
 
263 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  35.25 
 
 
255 aa  134  9e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  35.43 
 
 
215 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  26.26 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  25.39 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  29.33 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  25.27 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  24.18 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0272  O-methyltransferase-like protein  32.08 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  28.09 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  30.52 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  26.6 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  22.87 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  23.16 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  22.92 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  22.38 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  21.46 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  22.92 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  22.92 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  22.92 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  23.81 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  23.08 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  22.92 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  22.92 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  22.92 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  23.08 
 
 
246 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  22.92 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.39 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.04 
 
 
354 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.36 
 
 
340 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  27.39 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  26.75 
 
 
271 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  22.99 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  33.77 
 
 
286 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  20.88 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  25.83 
 
 
285 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  29.61 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  28.26 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.73 
 
 
367 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  21.94 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  21.93 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  22.77 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  27.64 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  22.63 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  23.04 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  21.76 
 
 
260 aa  52.4  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  24.31 
 
 
233 aa  52  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.63 
 
 
330 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  23.28 
 
 
249 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  27.57 
 
 
232 aa  52  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  24.32 
 
 
246 aa  52  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  27.21 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>