More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3811 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  100 
 
 
245 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  93.88 
 
 
245 aa  487  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  93.88 
 
 
245 aa  487  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  93.88 
 
 
245 aa  487  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  94.69 
 
 
245 aa  488  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  93.88 
 
 
245 aa  487  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  93.88 
 
 
245 aa  487  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  93.88 
 
 
245 aa  487  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  94.69 
 
 
245 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  73.06 
 
 
245 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  55.88 
 
 
248 aa  279  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  56.72 
 
 
248 aa  267  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  55.92 
 
 
248 aa  266  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  52.28 
 
 
252 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  51.87 
 
 
248 aa  258  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  51.87 
 
 
248 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  52.05 
 
 
260 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  50.8 
 
 
265 aa  248  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  40.85 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  38.89 
 
 
239 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  41.08 
 
 
243 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  41.38 
 
 
240 aa  170  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  39.08 
 
 
239 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  41.28 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  36.4 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  41.28 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  38.68 
 
 
240 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  38.4 
 
 
238 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  40.42 
 
 
241 aa  158  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  39.15 
 
 
235 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  37.86 
 
 
243 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  40.09 
 
 
247 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  39.32 
 
 
234 aa  155  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  40.57 
 
 
265 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  41.1 
 
 
215 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  40.45 
 
 
220 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  38.84 
 
 
240 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  33.88 
 
 
244 aa  148  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  37.82 
 
 
238 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  35.89 
 
 
251 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  35.04 
 
 
236 aa  145  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  37.82 
 
 
238 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  37.39 
 
 
238 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  36.12 
 
 
264 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  37.39 
 
 
238 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  33.73 
 
 
253 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  34.47 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  34.71 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  33.19 
 
 
234 aa  128  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  34.98 
 
 
255 aa  122  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  33.2 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  30 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  28.49 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  28.95 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  29.19 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  29.53 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  28 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  27.88 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  24.16 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  34.01 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.32 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  26.36 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  31.68 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  27.62 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  23.93 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  29.65 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.43 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  28.43 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  30.77 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  30.77 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  30.15 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  25.67 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  22.76 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.89 
 
 
354 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  39.74 
 
 
285 aa  62  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  29.86 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0822  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.38 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  25.99 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  25 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  27.73 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  25.42 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.89 
 
 
330 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  24.68 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.57 
 
 
343 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  24.7 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  28.24 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  27.97 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  25 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.09 
 
 
287 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  28.67 
 
 
179 aa  56.2  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  26.83 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.07 
 
 
340 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  26.13 
 
 
233 aa  55.5  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0866  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.82 
 
 
309 aa  55.5  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2092  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.4 
 
 
300 aa  55.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  24.29 
 
 
248 aa  55.5  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2160  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.76 
 
 
314 aa  55.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.971286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  29.71 
 
 
326 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.87 
 
 
302 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.24 
 
 
367 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>