More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0192 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  500  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  56.9 
 
 
239 aa  287  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  57.67 
 
 
215 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  50 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  44.49 
 
 
236 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  44.44 
 
 
243 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  43.64 
 
 
236 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  42 
 
 
251 aa  174  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  39.2 
 
 
265 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  42.8 
 
 
241 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  39.83 
 
 
248 aa  167  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  39.83 
 
 
248 aa  167  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  38.2 
 
 
240 aa  167  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  39.42 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  40 
 
 
248 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  39.16 
 
 
264 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  38.68 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  42.56 
 
 
248 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  40.93 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  41.18 
 
 
238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  40.51 
 
 
238 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  40.08 
 
 
238 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  40.08 
 
 
238 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  39.26 
 
 
243 aa  158  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  39.15 
 
 
236 aa  157  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  40.34 
 
 
247 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  39.5 
 
 
245 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  34.47 
 
 
236 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  36.36 
 
 
248 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  36.48 
 
 
234 aa  151  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.43 
 
 
245 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  38.43 
 
 
245 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  35.04 
 
 
235 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  38.43 
 
 
245 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  38.43 
 
 
245 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  38.43 
 
 
245 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  36.47 
 
 
265 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  38.43 
 
 
245 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  38.43 
 
 
245 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  38.84 
 
 
245 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  38.43 
 
 
245 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  36.48 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  36.29 
 
 
240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  35.47 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  41.18 
 
 
220 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  34.62 
 
 
263 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  32.65 
 
 
248 aa  134  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  36.67 
 
 
255 aa  131  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  30.28 
 
 
253 aa  118  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  31.51 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  32.08 
 
 
243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  27.33 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  25.95 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  25.71 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  25.95 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0822  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.05 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  32.52 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  25.85 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  27.17 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  25.55 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  25.33 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  28.57 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  26.63 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.07 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  26.63 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  26.63 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  26.63 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  26.63 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  26.63 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  26.63 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2508  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.07 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  26.63 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.52 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2597  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.07 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  26.63 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  28.97 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  28.97 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2812  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.92 
 
 
310 aa  65.1  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3240  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.07 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1569  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.07 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.340756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2072  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.07 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1344  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.07 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  33.59 
 
 
301 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  27.42 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.18 
 
 
317 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  35.38 
 
 
326 aa  63.5  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  26.44 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  24.06 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  34.57 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.25 
 
 
330 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002862  hypothetical adenine-specific methylase yfcB  33.75 
 
 
310 aa  62.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35 
 
 
343 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  19.9 
 
 
233 aa  62  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  24.04 
 
 
246 aa  62  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  23.29 
 
 
240 aa  62  0.000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.94 
 
 
302 aa  61.6  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.9 
 
 
286 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  21.5 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  26.78 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  24.12 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>