More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2942 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  100 
 
 		 245 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  97.96 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  97.96 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  97.96 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  97.96 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  97.96 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  98.78 
 
 		 245 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  97.96 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  94.69 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  72.24 
 
 		 245 aa  374  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  55.88 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  57.14 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  55.1 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  51.87 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  52.46 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  51.87 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  51.87 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  51.2 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  42.13 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  41.81 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  38.46 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  41.49 
 
 		 243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  42.98 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  39.5 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  42.98 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  41.67 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  38.68 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  38.82 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  36.02 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  39.57 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  39.66 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  37.45 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  41.55 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  39.32 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  39.62 
 
 		 265 aa  151  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  41.36 
 
 		 220 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  34.57 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  38.43 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  37.82 
 
 		 238 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  37.82 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  36.29 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  37.39 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  37.39 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  36.88 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  33.73 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  34.19 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  34.89 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  35.12 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  33.61 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  35.27 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  34.27 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  30.05 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  27.37 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  29.41 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  28.57 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  28.42 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  29.27 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  27.31 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  24.16 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  30.65 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  32.89 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.3 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  25.27 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  29.7 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  23.64 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.77 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  31.2 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  31.2 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  30.94 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  26.2 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  28.87 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.92 
 
 		 354 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  38.64 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  23.24 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0822  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.75 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.94 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  28.18 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  31.43 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  26.11 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  31.47 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.92 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  30.43 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  26.52 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.62 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  24.03 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  25.42 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.07 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  25.3 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.11 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  24.46 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.04 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.11 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  26.83 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  27.04 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  35.11 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2812  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.87 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  27.7 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  30.89 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>