More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04650 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  58.23 
 
 		 235 aa  287  9e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  56.12 
 
 		 240 aa  268  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  39.32 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  41.53 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  38.24 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  36.75 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  36.6 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  38.24 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  36.97 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  36.97 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  37.87 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  34.47 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  34.3 
 
 		 265 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  35.71 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  35.39 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  36.05 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  36.51 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  35.15 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  36.78 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  35.39 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  34.19 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  35.04 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  36.86 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  34.19 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  34.19 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.19 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  34.19 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  34.19 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  34.19 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  34.19 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  34.19 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  34.89 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  36.02 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  34.19 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  34.18 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  35.59 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  34.19 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  34.19 
 
 		 245 aa  141  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  34.39 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  33.6 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  33.33 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  33.76 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  34.3 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  32.68 
 
 		 263 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  36.13 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  33.33 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  34.68 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  33.2 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  33.6 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  31.06 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  28.33 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  23.12 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  28.24 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  27.47 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  25.36 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  25.76 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  24.59 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  27.5 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  27.63 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  23.61 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  24.55 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  23.95 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  23.08 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  24.55 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  23.95 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  23.95 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  23.95 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  23.95 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  23.95 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  23.95 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  23.95 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  26.06 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.32 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  24.65 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  24.56 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  21.82 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  28.99 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  24.87 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  22.02 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  22.86 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  22.86 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.46 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  27.93 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0272  O-methyltransferase-like protein  26.06 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  34.94 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  26.45 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  23.87 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  23.87 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  30 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  28.48 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  25.15 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  28.03 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.56 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.03 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  29.89 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  35 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  24.14 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>