181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2793 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  59.29 
 
 		 265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  59.83 
 
 		 248 aa  284  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  55.92 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  55.1 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  54.69 
 
 		 245 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  54.69 
 
 		 245 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  54.69 
 
 		 245 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  54.69 
 
 		 245 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  54.69 
 
 		 245 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  56.07 
 
 		 248 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  54.69 
 
 		 245 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  55.1 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  49.79 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  49.79 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  49.38 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  54.81 
 
 		 245 aa  251  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  52.54 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  39.26 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  40.51 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  37.61 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  36.6 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  37.86 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  35.56 
 
 		 239 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  35.85 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  37.87 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  38.64 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  32.32 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  36.4 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  36.36 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  33.06 
 
 		 240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  36.1 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  35.59 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  33.33 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  35.59 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  37.02 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  34.18 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  35.8 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  32.28 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  33.73 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  35.71 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  34.6 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  34.6 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  37.39 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  35.02 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  35.2 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  32.91 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  38.67 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  32.26 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  30.21 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  31.85 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  32.72 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  32.91 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  22.35 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  26.16 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  29.13 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  30.26 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.64 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  22.29 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  22.94 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  28 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  27.27 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  28.57 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  28.73 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  28.47 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  21.69 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  28.23 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  26.87 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  22.54 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  25.16 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  27.6 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  27.02 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  22.88 
 
 		 338 aa  55.5  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  29.29 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  30.07 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  27.43 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  28.26 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  27.59 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  31.45 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  23.08 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  28 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  24.2 
 
 		 330 aa  52.4  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  25 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  25.56 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  35.56 
 
 		 303 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  35.56 
 
 		 303 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  20.95 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  31.01 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  27.65 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  21.15 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.8 
 
 		 367 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  22.6 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  26.83 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  27.22 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  30.49 
 
 		 288 aa  48.5  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  22.82 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>