More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2876 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  70.71 
 
 		 258 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  63.37 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  60.17 
 
 		 258 aa  278  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  54.36 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  59.66 
 
 		 266 aa  258  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  51.67 
 
 		 268 aa  225  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  44.17 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  35.83 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  36.77 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  37.13 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  36.32 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  39.04 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  36.86 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  33.88 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  32.92 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  37.92 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  37.04 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  36.89 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  37.45 
 
 		 246 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  37.3 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  37.3 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  36.89 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  36.89 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  36.89 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  36.89 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  36.89 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  34.69 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  36.18 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  33.47 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  31.98 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  39.2 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  32.65 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  30.67 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  30.29 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  31.65 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  31.56 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  37.32 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  29.88 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  28.22 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  34.84 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  28.22 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  32.17 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  28.63 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  31.8 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  30.45 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  26.32 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  32.23 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  29.86 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  33.33 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  31.67 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  26.89 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  30.97 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  31.2 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  31.2 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  26.96 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  31.28 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  27.91 
 
 		 222 aa  92  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  27.01 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  32.27 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  25.33 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  29.75 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  27.2 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  27.01 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  27.01 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  24.31 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  28.96 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  27.52 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  25.5 
 
 		 232 aa  85.9  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  30.42 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  30.4 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  31.36 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  32.13 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  31.22 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  30 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  31.93 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  26.15 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  30.95 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  27.96 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  32.8 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  29 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  28.42 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.42 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  28.42 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  28.42 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  28.42 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  28.42 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  28.42 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  28.42 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  33.14 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  28.33 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  38.98 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  27.31 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  28.1 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  28.33 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  26.79 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  28.33 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>