113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1759 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  771    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  49.82 
 
 
438 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  43.82 
 
 
275 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  41.25 
 
 
268 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  41.94 
 
 
249 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  33.48 
 
 
241 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  35.16 
 
 
335 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  29.11 
 
 
256 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  32.64 
 
 
249 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  30.64 
 
 
258 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  31.36 
 
 
255 aa  90.1  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  31.91 
 
 
245 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  33.56 
 
 
240 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  26.07 
 
 
256 aa  86.7  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  29.26 
 
 
211 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  28.8 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  32.47 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  27.73 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  27.31 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  29.94 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  25.21 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
248 aa  79.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  31.15 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  29.87 
 
 
268 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  23.71 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  25.2 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  38.98 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  31.25 
 
 
256 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  31.3 
 
 
250 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  26.56 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  36.52 
 
 
216 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  28.78 
 
 
262 aa  72  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  24.9 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  37.39 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  23.38 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  32.17 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  31.74 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  25.42 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  32.22 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  30.51 
 
 
228 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  26.56 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  20.99 
 
 
233 aa  67  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  23.24 
 
 
220 aa  65.9  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  24.02 
 
 
241 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  24.02 
 
 
241 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  19.34 
 
 
233 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  24.23 
 
 
233 aa  65.1  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  28.03 
 
 
254 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  31.36 
 
 
241 aa  63.2  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  30.16 
 
 
222 aa  63.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  27.83 
 
 
232 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  34.6 
 
 
250 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.7 
 
 
253 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  28.7 
 
 
253 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  18.61 
 
 
235 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  24.78 
 
 
237 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  24.62 
 
 
330 aa  61.2  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  30.94 
 
 
271 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  28.76 
 
 
257 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  21.71 
 
 
233 aa  60.8  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  26.52 
 
 
254 aa  60.5  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  27.2 
 
 
240 aa  60.5  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  20.23 
 
 
237 aa  60.1  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  34.19 
 
 
242 aa  60.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  18.93 
 
 
233 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  29.27 
 
 
246 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  21.19 
 
 
263 aa  59.7  0.00000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  24.79 
 
 
246 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  28.69 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  28.69 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  28.69 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  34.11 
 
 
259 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  24.89 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  28.69 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  24.47 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  28.69 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  38.97 
 
 
260 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  28.69 
 
 
246 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  28.69 
 
 
246 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  35.66 
 
 
288 aa  57  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  23.5 
 
 
223 aa  57  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  21.79 
 
 
231 aa  55.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  30.58 
 
 
263 aa  55.5  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  30.04 
 
 
239 aa  53.5  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  30.39 
 
 
249 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  35 
 
 
259 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  31.62 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1627  modification methylase, HemK family  44.83 
 
 
305 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  21.6 
 
 
231 aa  50.4  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  23.03 
 
 
338 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  47.37 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  45.16 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  39.78 
 
 
298 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  26.12 
 
 
286 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  35.48 
 
 
186 aa  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  28.12 
 
 
247 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  31.71 
 
 
257 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  40.68 
 
 
297 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 
363 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>