177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0709 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  100 
 
 
286 aa  565  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  60.24 
 
 
264 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  61.35 
 
 
252 aa  263  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  61.35 
 
 
252 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  52.17 
 
 
263 aa  240  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  55.16 
 
 
258 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  55.1 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  53.88 
 
 
256 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  51.93 
 
 
242 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  48.8 
 
 
257 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  42.91 
 
 
252 aa  148  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  38.68 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  38.27 
 
 
250 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  37.86 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  41.83 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  40.56 
 
 
259 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  34.65 
 
 
260 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  41.02 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  40.73 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  42.55 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  41.67 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  37.72 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  38.61 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  38.55 
 
 
265 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  39.48 
 
 
257 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  40.23 
 
 
250 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  33.62 
 
 
253 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  33.62 
 
 
253 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  32.79 
 
 
262 aa  102  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  34.4 
 
 
247 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  33.33 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  34.01 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  32.62 
 
 
256 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  31.75 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  37.42 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  31.36 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  33.19 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  31.74 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.18 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  25.67 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  27.5 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  25 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  23.36 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  34.55 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  28.4 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  27.17 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  22.46 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  19.66 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  27.87 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  24.05 
 
 
241 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  21.74 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  27.78 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  25.97 
 
 
249 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  27.06 
 
 
249 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  24.02 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  20.91 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  29.39 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  21.76 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  26.59 
 
 
255 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  26.67 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  30.56 
 
 
211 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  25.88 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  27.83 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  21.3 
 
 
246 aa  59.3  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  20.93 
 
 
233 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  32.31 
 
 
438 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  20.93 
 
 
233 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  27.47 
 
 
335 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  25.69 
 
 
228 aa  55.8  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  20.47 
 
 
233 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  25.42 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  23.79 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  27.95 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  21.76 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  26.19 
 
 
338 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  21.68 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2296  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.92 
 
 
382 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  22.66 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.65 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  24.14 
 
 
246 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  23.48 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  22.84 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  24.27 
 
 
235 aa  50.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  30.93 
 
 
284 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  32 
 
 
284 aa  49.3  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  39.08 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  26.12 
 
 
398 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  38.04 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  26.32 
 
 
234 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_92293  predicted protein  32.21 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  36.56 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.78 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  25.42 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2739  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.11 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  36.05 
 
 
280 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  32.65 
 
 
293 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  34.55 
 
 
324 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03082  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  35.77 
 
 
336 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>