93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2484 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  863    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  49.82 
 
 
398 aa  190  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  57.14 
 
 
275 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  36.76 
 
 
335 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  50.64 
 
 
249 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  47.83 
 
 
268 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  48.74 
 
 
249 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  31.21 
 
 
245 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  39.17 
 
 
248 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  38.52 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  40.77 
 
 
258 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  42.02 
 
 
248 aa  82.4  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  41.53 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  28.77 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  35.38 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  27.12 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  34.51 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  29.55 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  29.15 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  38.98 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  36.72 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  24.71 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  36.92 
 
 
211 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  27.72 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  36.92 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  34.48 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  28.67 
 
 
250 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  35.65 
 
 
241 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  31.82 
 
 
247 aa  65.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  25.93 
 
 
233 aa  63.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  30.65 
 
 
246 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
260 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  33.91 
 
 
240 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  29.84 
 
 
246 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  29.41 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  34.81 
 
 
252 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  27.69 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  26.06 
 
 
246 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  37.4 
 
 
253 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  25.2 
 
 
235 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  31.9 
 
 
249 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  29.84 
 
 
246 aa  60.1  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  29.84 
 
 
246 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  29.84 
 
 
246 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  29.84 
 
 
246 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  29.84 
 
 
246 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  36.59 
 
 
253 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  32.81 
 
 
259 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  29.84 
 
 
246 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  26.47 
 
 
262 aa  59.7  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  28.46 
 
 
220 aa  59.3  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  29.84 
 
 
246 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  30.51 
 
 
237 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  25.78 
 
 
233 aa  59.7  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  32.31 
 
 
286 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  31.07 
 
 
222 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  29.69 
 
 
249 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  32.81 
 
 
288 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  35.29 
 
 
249 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  23.85 
 
 
231 aa  57.4  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  30.16 
 
 
251 aa  57  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  31.93 
 
 
251 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  33.33 
 
 
265 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  25.78 
 
 
233 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  34.62 
 
 
271 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  25 
 
 
233 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  25 
 
 
233 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  26.4 
 
 
254 aa  53.5  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  25.98 
 
 
231 aa  52.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  27.5 
 
 
246 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  34.71 
 
 
239 aa  51.6  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  33.33 
 
 
259 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  38.1 
 
 
250 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  31.01 
 
 
253 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  30.53 
 
 
263 aa  50.1  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  28.26 
 
 
261 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  25.74 
 
 
240 aa  49.7  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  32.5 
 
 
242 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  28.07 
 
 
235 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
216 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  26.56 
 
 
252 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  26.56 
 
 
252 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  36.44 
 
 
256 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  27.83 
 
 
217 aa  47.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  35.61 
 
 
260 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  31.4 
 
 
257 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  23.67 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  26.55 
 
 
223 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  21.26 
 
 
230 aa  44.7  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  25.78 
 
 
264 aa  43.1  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  31.36 
 
 
257 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>