More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0108 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 363 aa  718    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  50.52 
 
 		 416 aa  328  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  54.73 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  51.64 
 
 		 356 aa  316  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  48.19 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  35.64 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  36.53 
 
 		 350 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  38.79 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  35.8 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  34.62 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  37.73 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  35.26 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  33.92 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  33.44 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  34.37 
 
 		 351 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  38.08 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  36.25 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  34.04 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  34.55 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  34.37 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  36.06 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  34.37 
 
 		 351 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  34.55 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  33.02 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  32.29 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  35.95 
 
 		 348 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  34.64 
 
 		 360 aa  159  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  33.75 
 
 		 353 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  32.01 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  32.05 
 
 		 357 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  33.63 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  29.22 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  33.24 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  32.2 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  25.21 
 
 		 344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  30.05 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  30.96 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  26.7 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 355 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 355 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 355 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  25.93 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 369 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 360 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  29.64 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  30.37 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  28.85 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  26.27 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  27.89 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  39.45 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.11 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  41.28 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.96 
 
 		 237 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.67 
 
 		 232 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.22 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.73 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.25 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 271 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.88 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.25 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2057  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.25 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  unclonable  0.00000000000181282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2288  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.25 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.67 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.25 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  0.0000107222 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.25 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.67 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  40.2 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.24 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.32 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00359705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.06 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.22 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.96 
 
 		 232 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  33.93 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.79 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.96 
 
 		 232 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.11 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.57 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.62 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.24 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>