More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18860 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  97.2 
 
 		 357 aa  706    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  744    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  41.19 
 
 		 351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  40.17 
 
 		 360 aa  262  8e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  38.64 
 
 		 353 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  40.91 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  40.34 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  37.46 
 
 		 353 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  37.54 
 
 		 357 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  37.78 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  36.87 
 
 		 360 aa  235  7e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  37.78 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  37.64 
 
 		 358 aa  233  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  38.51 
 
 		 350 aa  226  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  34.66 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  34.66 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  36.18 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  34.56 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  35.51 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  38.12 
 
 		 359 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  36.75 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  34.47 
 
 		 353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 348 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  36.69 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  36.75 
 
 		 348 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  36.18 
 
 		 348 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  33.9 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  34.85 
 
 		 343 aa  195  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  30.62 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  34.5 
 
 		 369 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  33.91 
 
 		 365 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  30.34 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  35.5 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  34.84 
 
 		 341 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 344 aa  175  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.01 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  32.36 
 
 		 355 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  32.36 
 
 		 355 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  32.36 
 
 		 355 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  32.49 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  30.79 
 
 		 353 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  31.86 
 
 		 376 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  32.15 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  29.24 
 
 		 416 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  29.57 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 362 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  34.86 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  39.81 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.18 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  33.67 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.55 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  42.86 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.12 
 
 		 279 aa  57  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.24 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  42.37 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.94 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03421  16S rRNA m2G 1207 methyltransferase  36.9 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.04 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2400  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.17 
 
 		 420 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  25.38 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.48 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.55 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.18 
 
 		 232 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  43.24 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  23.81 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 278 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.22 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.41 
 
 		 232 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  34.44 
 
 		 274 aa  53.5  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  35 
 
 		 285 aa  53.1  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0428  Methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 361 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.92 
 
 		 302 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 197 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 266 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.94 
 
 		 275 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  25.95 
 
 		 422 aa  52.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  39.29 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.78 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>