More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1632 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  743    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  97.2 
 
 		 357 aa  705    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  41.19 
 
 		 351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  40.17 
 
 		 360 aa  262  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  39.49 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  40.34 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  40.62 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  38.92 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  38.07 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  36.87 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  37.78 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  37.92 
 
 		 358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  38.79 
 
 		 350 aa  226  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  34.66 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  34.66 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  34.56 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  35.04 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  37.32 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  35.8 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 348 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  37.32 
 
 		 348 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 351 aa  215  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  36.87 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  37.24 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  34.19 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  36.18 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  34.47 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  35.15 
 
 		 343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  30.9 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  33.8 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  30.62 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  35.8 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  34.59 
 
 		 369 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  33.93 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  34.52 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  33.97 
 
 		 344 aa  173  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 363 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 356 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 356 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  33.43 
 
 		 360 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  32.45 
 
 		 376 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  30.14 
 
 		 418 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  28.98 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 362 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  35.78 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  39.81 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.89 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.18 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.69 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  32.65 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.24 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 274 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  42.37 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  32.94 
 
 		 279 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  24.77 
 
 		 186 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.94 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  25 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  44.64 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2400  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.17 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1418  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 234 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.69 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.56 
 
 		 305 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.1 
 
 		 232 aa  53.9  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.4 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03421  16S rRNA m2G 1207 methyltransferase  36.59 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  43.24 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  36.59 
 
 		 285 aa  53.5  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.57 
 
 		 297 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  27.57 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 266 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  22.9 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 268 aa  52.8  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 272 aa  52.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 228 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  36.63 
 
 		 287 aa  52.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 314 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 311 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  33.33 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.79 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.03 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>