212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2927 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  96.55 
 
 		 348 aa  670    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  92.53 
 
 		 348 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  99.43 
 
 		 348 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  75.86 
 
 		 348 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  59.6 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  59.6 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  57.47 
 
 		 353 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  59.6 
 
 		 351 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  56.9 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  57.88 
 
 		 351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  57.31 
 
 		 351 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  56.73 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  53.3 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  55.91 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  52.89 
 
 		 349 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  52.29 
 
 		 358 aa  362  6e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  55.17 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  51.58 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  52.44 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  52.29 
 
 		 351 aa  349  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  51 
 
 		 353 aa  348  7e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  51.86 
 
 		 357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  51.86 
 
 		 359 aa  339  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  49 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  47.28 
 
 		 350 aa  315  7e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  47.66 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  38.35 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  37.78 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  39.09 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 363 aa  165  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  31.16 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  30.86 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  31.27 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  28.74 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 363 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  29.49 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  34.01 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 344 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  32.93 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  31.64 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  28.49 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 353 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  31.81 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.66 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  34.21 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.81 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  37.1 
 
 		 264 aa  52.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  34.19 
 
 		 280 aa  52.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.51 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  24.01 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  27.88 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 273 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 226 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.34 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 281 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 234 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 228 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 187 aa  49.3  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  31.3 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.03 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 254 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  28.7 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  25 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  24.8 
 
 		 186 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 208 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1069  hypothetical protein  58.14 
 
 		 140 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  27.08 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 286 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  30 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>