More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3189 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  100 
 
 
187 aa  388  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  40.22 
 
 
199 aa  160  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  40.98 
 
 
195 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  42.37 
 
 
187 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  36.67 
 
 
184 aa  124  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4101  methyltransferase type 11  40.78 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0157536  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  30 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  32 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.74 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  31.53 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  50 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  31.48 
 
 
265 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
363 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.78 
 
 
242 aa  61.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  29.91 
 
 
249 aa  61.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  33.64 
 
 
357 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
278 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1003  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00822165  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
273 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  34.51 
 
 
350 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.78 
 
 
245 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
199 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2692  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
190 aa  59.3  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  33.83 
 
 
1128 aa  58.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  26.43 
 
 
278 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.18 
 
 
234 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  58.2  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  31.69 
 
 
351 aa  57.8  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  27.21 
 
 
216 aa  57.8  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 
415 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
240 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  30.94 
 
 
282 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.52 
 
 
237 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
355 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.18 
 
 
234 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
241 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
241 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.99 
 
 
239 aa  55.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.22 
 
 
242 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  26.27 
 
 
209 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  27.2 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.75 
 
 
237 aa  55.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.94 
 
 
235 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.64 
 
 
260 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000544337  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
252 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  31.86 
 
 
351 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  35.4 
 
 
353 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
208 aa  55.1  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
287 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  34.78 
 
 
360 aa  54.3  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  27.94 
 
 
269 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  28 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
238 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  38.98 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2580  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.36 
 
 
249 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  26.35 
 
 
251 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
285 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.11 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.52 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
360 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.09 
 
 
233 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.7 
 
 
238 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.77 
 
 
237 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.03 
 
 
241 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  34.55 
 
 
359 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.2 
 
 
234 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
285 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5491  methyltransferase  31.86 
 
 
281 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
285 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.86 
 
 
241 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
280 aa  52  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.86 
 
 
235 aa  52  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.27 
 
 
283 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 
358 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
238 aa  52  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  28.43 
 
 
395 aa  51.6  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  40.98 
 
 
196 aa  52  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  32.08 
 
 
241 aa  51.6  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
390 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  23.13 
 
 
397 aa  51.6  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.12 
 
 
271 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  24.77 
 
 
235 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
202 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  30.82 
 
 
207 aa  51.6  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>