273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2836 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  100 
 
 		 362 aa  716    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  48.75 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  48.47 
 
 		 356 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  43.64 
 
 		 416 aa  258  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  47.16 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  35.01 
 
 		 365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  31.61 
 
 		 358 aa  132  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  32.66 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  32.02 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  30.56 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  32.66 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  29.97 
 
 		 357 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  32.58 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  34.38 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  30.99 
 
 		 351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 351 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  33.15 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  32.68 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  31.09 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  31.81 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  30.97 
 
 		 365 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  32.61 
 
 		 348 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 		 351 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  27.7 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  31.21 
 
 		 351 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  32.12 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  31.89 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  26.76 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 353 aa  119  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  29.06 
 
 		 348 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  31.95 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  33.55 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  31.2 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  29.75 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  31.83 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  30.27 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  28.45 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  33.23 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  27.93 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 356 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.44 
 
 		 418 aa  93.2  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  29.18 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  27.93 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  27.49 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0377  demethylmenaquinone methyltransferase  26.67 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 268 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1199  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_341  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase  25.74 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  27.19 
 
 		 1372 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.29 
 
 		 249 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.64 
 
 		 237 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0650  hypothetical protein  38.1 
 
 		 272 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  32.77 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 263 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 268 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5675  Methyltransferase type 12  26.44 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 226 aa  49.7  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  29.23 
 
 		 422 aa  49.7  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  27.01 
 
 		 258 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  25.44 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.48 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.51 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.36 
 
 		 234 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.1 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2399  O-methyltransferase  21.6 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.32 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 199 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0549  hypothetical protein  24.24 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  36.04 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 239 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.53 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4875  methyltransferase type 12  28.86 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.69 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28 
 
 		 232 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  34.71 
 
 		 226 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.58 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>