111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0650 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0650  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  559  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1199  methyltransferase type 11  91.18 
 
 
286 aa  513  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
363 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  26.35 
 
 
320 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  45 
 
 
230 aa  55.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1319  methyltransferase type 12  28.31 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6510  methyltransferase type 12  28.31 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.71 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6101  methyltransferase type 11  27.71 
 
 
320 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
199 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
362 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.15 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  34.95 
 
 
351 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  32.53 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  29.73 
 
 
351 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  31.67 
 
 
211 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
199 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.36 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
203 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  37.66 
 
 
351 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
196 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
261 aa  48.9  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
257 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  32.56 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  48.84 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  32.23 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  24.59 
 
 
286 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  37.68 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
356 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  26.37 
 
 
297 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5945  methyltransferase type 12  26.75 
 
 
677 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.72 
 
 
233 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  24.29 
 
 
202 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  35.53 
 
 
353 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  46.51 
 
 
230 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  29.17 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  33.72 
 
 
353 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
355 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  30.91 
 
 
226 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
224 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  38.46 
 
 
535 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  28.46 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.03 
 
 
269 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  28.28 
 
 
273 aa  46.2  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.75 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.83 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  28.81 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  35.44 
 
 
350 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  25.47 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  37.31 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.11 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.44 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.78 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.23 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  27.83 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  30.25 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  26.99 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.73 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  32.91 
 
 
521 aa  43.9  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.67 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.57 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  29.48 
 
 
282 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.73 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  38.78 
 
 
224 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  24.4 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  29.55 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  29.66 
 
 
414 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4739  methyltransferase type 11  28.4 
 
 
209 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.673434  hitchhiker  0.00496739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.89 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  32.69 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.61 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.92 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.73 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.63 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  26.61 
 
 
232 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  30.7 
 
 
343 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  30.38 
 
 
298 aa  42.7  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  36.56 
 
 
203 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
187 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  32.52 
 
 
211 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  27.18 
 
 
308 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
226 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>