More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1457 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  100 
 
 
344 aa  717    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  55.43 
 
 
365 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  51.74 
 
 
355 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  55.38 
 
 
360 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  51.74 
 
 
355 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  51.74 
 
 
355 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  53.67 
 
 
365 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  51.6 
 
 
356 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  51.6 
 
 
356 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  52.49 
 
 
376 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  51.17 
 
 
353 aa  368  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  47.69 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  48.37 
 
 
369 aa  347  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  46.36 
 
 
360 aa  334  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  48.69 
 
 
380 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  48.12 
 
 
367 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  44.74 
 
 
363 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  45.99 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  46.94 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  44.61 
 
 
356 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 
366 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  31.27 
 
 
353 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  34.62 
 
 
357 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  33.86 
 
 
341 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  33.97 
 
 
357 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  31.12 
 
 
351 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  30.75 
 
 
351 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  31.96 
 
 
353 aa  165  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  30.84 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  32.24 
 
 
349 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 
360 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  33.76 
 
 
359 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  32.18 
 
 
357 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  30.06 
 
 
353 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  32.69 
 
 
357 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  28.98 
 
 
351 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  30.58 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  28.99 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  29.83 
 
 
351 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  30.35 
 
 
353 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  27 
 
 
351 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  30.4 
 
 
348 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  28.08 
 
 
357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  29.97 
 
 
418 aa  132  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
348 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
348 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  28.01 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  25.21 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  25.93 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  28.88 
 
 
358 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  30.09 
 
 
348 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  26.97 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  25 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  23.77 
 
 
416 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  25.57 
 
 
356 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  33.58 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  34.53 
 
 
355 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  36.61 
 
 
261 aa  67  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0377  demethylmenaquinone methyltransferase  31.15 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
265 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
264 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
262 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  34.58 
 
 
205 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.64 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  31.82 
 
 
313 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  30.14 
 
 
269 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
263 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
263 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
263 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
209 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
267 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 
246 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.68 
 
 
263 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
252 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
402 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  29.21 
 
 
211 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  29.45 
 
 
269 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  33 
 
 
535 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
272 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  25.14 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  42.55 
 
 
230 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.45 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
199 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  25.26 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  26.72 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
263 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  27.36 
 
 
204 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>