More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2845 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  96.26 
 
 		 348 aa  688    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  96.55 
 
 		 348 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  100 
 
 		 348 aa  715    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  92.82 
 
 		 348 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  76.72 
 
 		 348 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  60.17 
 
 		 351 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  60.17 
 
 		 351 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  60.17 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  57.18 
 
 		 353 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  58.45 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  56.61 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  58.45 
 
 		 351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  57.02 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  56.77 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  53.3 
 
 		 351 aa  378  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  52 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  52.31 
 
 		 349 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  54.6 
 
 		 357 aa  362  6e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  51 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  52.44 
 
 		 360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  52.86 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  50.14 
 
 		 353 aa  345  5e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  51.86 
 
 		 357 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  51.86 
 
 		 359 aa  341  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  49.57 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  47.28 
 
 		 350 aa  317  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  47.08 
 
 		 343 aa  292  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  38.64 
 
 		 357 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  37.78 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  39.94 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  31.75 
 
 		 356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  34.66 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  31.45 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  33.44 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  30.99 
 
 		 360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  29.8 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  29.49 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  32.27 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  32.54 
 
 		 380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  32.66 
 
 		 362 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  33.23 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  28.77 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 367 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  32.09 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 286 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.59 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  27.41 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  24.62 
 
 		 353 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.81 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  35.09 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 268 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 271 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.78 
 
 		 447 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 242 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  30.83 
 
 		 268 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 242 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 286 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.73 
 
 		 237 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2180  methyltransferase type 12  30.65 
 
 		 205 aa  53.5  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  27.87 
 
 		 196 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 285 aa  53.1  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 276 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  27.87 
 
 		 208 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  26.25 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  28.69 
 
 		 196 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  25.62 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  26.23 
 
 		 196 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  25.62 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>