More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0328 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  718    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  67.52 
 
 		 351 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  65.34 
 
 		 351 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  66.95 
 
 		 353 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  65.24 
 
 		 351 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  62.39 
 
 		 351 aa  472  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  65.24 
 
 		 351 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  64.08 
 
 		 353 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  61.93 
 
 		 353 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  59.31 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  58 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  59.14 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  59.03 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  55.87 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  58.45 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  60.29 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  56.7 
 
 		 351 aa  398  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  57.31 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  57.31 
 
 		 348 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  55.3 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  55.4 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  54.13 
 
 		 353 aa  381  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  55.43 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  52.01 
 
 		 349 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  51.14 
 
 		 357 aa  338  9e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  50.14 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  48.97 
 
 		 343 aa  318  7.999999999999999e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  37.78 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  37.78 
 
 		 357 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  34.48 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  34.66 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  32.94 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  32.15 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  27 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  27.67 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  27.67 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  28.93 
 
 		 376 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  31.04 
 
 		 380 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 362 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  29.31 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  28.62 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  26.44 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  23.76 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  38.94 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 285 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.29 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  27.14 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  28.63 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2180  methyltransferase type 12  35.78 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  24.58 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1069  hypothetical protein  62.79 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.73 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  30 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  31.54 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.96 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38159  predicted protein  26.43 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  30.91 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  28.75 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.4 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  32.46 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.65 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  27.93 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  29.79 
 
 		 232 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 267 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>