270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5910 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  100 
 
 
353 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  92.35 
 
 
353 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  64.08 
 
 
351 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  58.91 
 
 
351 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  57.71 
 
 
353 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  58.67 
 
 
351 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  58.26 
 
 
351 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  58.67 
 
 
351 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  56.9 
 
 
348 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  55.07 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  56.61 
 
 
348 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  56.61 
 
 
357 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  56.9 
 
 
348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  54.89 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  54.7 
 
 
360 aa  398  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  54.89 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  55.46 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  54.89 
 
 
348 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  53.76 
 
 
353 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  51.44 
 
 
358 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  52.59 
 
 
350 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  50.57 
 
 
349 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  50.57 
 
 
357 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  51.15 
 
 
359 aa  359  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  48.85 
 
 
357 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  50.86 
 
 
351 aa  355  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  48.67 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  40.34 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  40.34 
 
 
357 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  33.75 
 
 
341 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  31.77 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
355 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
355 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
355 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  32.24 
 
 
365 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  32.36 
 
 
369 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  31.21 
 
 
353 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  30.35 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  29.25 
 
 
356 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
356 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  29.25 
 
 
356 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  31.59 
 
 
360 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  30.45 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  28.94 
 
 
363 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  28.07 
 
 
376 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  30.06 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  27.6 
 
 
360 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  30.27 
 
 
418 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 
356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  26 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  30 
 
 
362 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
366 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  35.96 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  42.47 
 
 
228 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
281 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  28.7 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  27.03 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
274 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.77 
 
 
213 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  37.61 
 
 
352 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  25.22 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
286 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  24.81 
 
 
411 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1069  hypothetical protein  60 
 
 
140 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
276 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
209 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
242 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
242 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
271 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  29.13 
 
 
395 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  28.17 
 
 
234 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  29.9 
 
 
230 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  25.56 
 
 
353 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30 
 
 
282 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.52 
 
 
402 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.77 
 
 
293 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
261 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
285 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.61 
 
 
414 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  24.06 
 
 
205 aa  52.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
187 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  32 
 
 
271 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  31.91 
 
 
363 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  25 
 
 
196 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.57 
 
 
296 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  32.04 
 
 
274 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>