More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1911 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 274 aa  542  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  40.49 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  36.59 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 305 aa  95.9  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  33.98 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0507  Methyltransferase type 12  36.47 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  32.57 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.67 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  31.46 
 
 		 323 aa  62  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.83 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.93 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.34 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.11 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05091  hypothetical protein  30 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.67 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  40.18 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4196  Methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  decreased coverage  0.00616764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  31.82 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  30.47 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  29.58 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 397 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  36.07 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  38.6 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.09 
 
 		 402 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.29 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 402 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 348 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  35.2 
 
 		 202 aa  52.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.07 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0428  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 361 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  30.91 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.08 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  31.37 
 
 		 350 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.9 
 
 		 420 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1943  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.415083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  30.56 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  25 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  31.3 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  28 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  30.43 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1285  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  24.62 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  28.82 
 
 		 422 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  24.62 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1900  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  28.7 
 
 		 403 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0314  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  34.86 
 
 		 405 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 206 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 354 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  30.48 
 
 		 331 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  39.34 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 349 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.78 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.18 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  26.05 
 
 		 251 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.84 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  30.07 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 342 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  24.6 
 
 		 199 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  29.76 
 
 		 376 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.89 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>