162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0428 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0428  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 361 aa  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1457  O-methyltransferase family protein  33.63 
 
 		 337 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527749  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  32.18 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2658  O-methyltransferase family 2  30.92 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2399  O-methyltransferase  29.38 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1315  O-methyltransferase family protein  30.19 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.575705  normal  0.038188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1487  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0859  QbsJ-like methyltransferase  30.09 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.226018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  30.3 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1821  Methyltransferase type 12  26.87 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  28.95 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.513829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1418  Methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  28.57 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  27.34 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0656  methyltransferase type 12  28.44 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  27.97 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  31 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  28.95 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  27.65 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  28.94 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0924  O-methyltransferase family protein  24.44 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  27.59 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5675  Methyltransferase type 12  26.7 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  26.73 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  27.43 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  27.68 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0362  O-methyltransferase family 2  23.49 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 344 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  29.1 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  38.05 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2553  methyltransferase  26.79 
 
 		 424 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0796954  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  27.88 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  30.88 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 196 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.59 
 
 		 305 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.21 
 
 		 223 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  30.92 
 
 		 225 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3571  SAM-dependent methyltransferase  25.87 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1991  hypothetical protein  22.68 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059131  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.38 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  29.35 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  25.45 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  24.53 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 235 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 247 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  26.13 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 246 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  24.65 
 
 		 398 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  24.74 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 251 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  25 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  28.93 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  34.95 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  27.1 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.04 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  22.43 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  22.89 
 
 		 205 aa  48.1  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  30 
 
 		 235 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  34.58 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  27.74 
 
 		 204 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 203 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 213 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 286 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 215 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.93 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 284 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 199 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  32.43 
 
 		 251 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4279  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.34 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 274 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  32.43 
 
 		 251 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  27.39 
 
 		 392 aa  46.2  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0954  methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.04 
 
 		 212 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  34.34 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  24.65 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0992  methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.33 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0108  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.51 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.69 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  27.68 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  30.89 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  26.24 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>