127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1457 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1457  O-methyltransferase family protein  100 
 
 		 337 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1487  methyltransferase type 12  39.33 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2399  O-methyltransferase  32.11 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1315  O-methyltransferase family protein  31.51 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.575705  normal  0.038188 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0428  Methyltransferase type 12  34.81 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2658  O-methyltransferase family 2  31.08 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0859  QbsJ-like methyltransferase  28.57 
 
 		 366 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.226018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  35.05 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1821  Methyltransferase type 12  28.39 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1418  Methyltransferase type 12  29 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0656  methyltransferase type 12  29.76 
 
 		 351 aa  99.8  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  27.19 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  34.25 
 
 		 358 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  29.24 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0493  hypothetical protein  24.38 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  32.95 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  28.81 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  28.39 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  31.05 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  27.49 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  27.83 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3571  SAM-dependent methyltransferase  25.98 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  32.82 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1495  hypothetical protein  22.49 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.114106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  27.96 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  25.35 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  27.91 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.513829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  31.2 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  28.12 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  32.62 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  29.93 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  35.8 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0924  O-methyltransferase family protein  25.27 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  26.47 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2553  methyltransferase  23.2 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0796954  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0412  hypothetical protein  21.29 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  28.2 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0362  O-methyltransferase family 2  25 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  27.59 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0422  hypothetical protein  21.15 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  25.53 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  25.66 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  26.83 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  27.25 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0423  hypothetical protein  21.62 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  27.01 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  27.97 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.59 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  26.81 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  36.54 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1625  O-methyltransferase family protein  26.4 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  32.1 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  36.61 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  25.23 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  33.59 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  26.82 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  26.82 
 
 		 473 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  26.82 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7514  hypothetical protein  26.69 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  27.27 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  27.27 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  23.62 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  27.27 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  42.86 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  24.46 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  28.46 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  30.82 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2955  O-methyltransferase family 2  29.89 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.108248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  23.9 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  26.89 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  36.04 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.37 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  25.32 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  32.38 
 
 		 246 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  26.89 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 226 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  23.48 
 
 		 630 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  32.35 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  30.13 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  30.51 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2124  O-methyltransferase family protein  28.24 
 
 		 371 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4875  methyltransferase type 12  32 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  34.09 
 
 		 630 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1007  O-methyltransferase family 2  24.14 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000712761 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  30.13 
 
 		 256 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.13 
 
 		 256 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  30.13 
 
 		 256 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  30.13 
 
 		 256 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  30.13 
 
 		 256 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  21.86 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  29.12 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 187 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  29.41 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2728  O-methyltransferase family protein  37.04 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>