219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2071 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  100 
 
 
335 aa  689    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  95.22 
 
 
335 aa  631  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  64.65 
 
 
334 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  59.52 
 
 
333 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  65.26 
 
 
332 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  60.12 
 
 
328 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  56.27 
 
 
329 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  46.95 
 
 
331 aa  300  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  36.71 
 
 
343 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  32.63 
 
 
338 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  31.42 
 
 
338 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  32.21 
 
 
353 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  28.66 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  28.74 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  33.77 
 
 
411 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  30.28 
 
 
352 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  30.16 
 
 
353 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1625  O-methyltransferase family protein  31.27 
 
 
378 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  28.7 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  29.94 
 
 
338 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1280  O-methyltransferase family protein, putative  31.51 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149461  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1506  O-methyltransferase  30.97 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0086  putative O-methyltransferase  30.65 
 
 
350 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  29.1 
 
 
364 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1589  O-methyltransferase  30.65 
 
 
350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  29.43 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  27.74 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0884  O-methyltransferase family protein  30.9 
 
 
312 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  29.97 
 
 
337 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  28.29 
 
 
345 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1007  O-methyltransferase family 2  30.03 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000712761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  30.13 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  30.43 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.53 
 
 
363 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.53 
 
 
363 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.53 
 
 
363 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2399  O-methyltransferase  27.86 
 
 
345 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.6 
 
 
331 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  28.75 
 
 
356 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
346 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5675  Methyltransferase type 12  27.71 
 
 
340 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196275  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  30.06 
 
 
381 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4167  O-methyltransferase family protein  31.73 
 
 
344 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116643  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  28.29 
 
 
360 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.513829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  25.82 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  29.43 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  29.43 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  29.43 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  29.43 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  29.43 
 
 
337 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  29.43 
 
 
337 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  29.43 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  25.32 
 
 
367 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  25.32 
 
 
473 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  25.32 
 
 
367 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  25.32 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3676  O-methyltransferase family 2  26.97 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410958  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  25.32 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  25.32 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  26.09 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  25.94 
 
 
339 aa  93.6  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  27.67 
 
 
339 aa  92.4  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.97 
 
 
381 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  26.76 
 
 
337 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  24.91 
 
 
339 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  24.76 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  25.55 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  29.2 
 
 
345 aa  89.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  25.25 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2553  methyltransferase  27.05 
 
 
424 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0796954  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1315  O-methyltransferase family protein  24.21 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.575705  normal  0.038188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  24.21 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  29.85 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5070  O-methyltransferase family 2  24.68 
 
 
369 aa  85.9  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.88726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  29.35 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2124  O-methyltransferase family protein  26.79 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  26.79 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.92 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  24.92 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2658  O-methyltransferase family 2  24.1 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  30.99 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  25.22 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  25.29 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  27.24 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  24.78 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3571  SAM-dependent methyltransferase  27.46 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0396758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.53 
 
 
362 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  24.78 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  28.02 
 
 
361 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  27.46 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.53 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.53 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  24.78 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  27.66 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  22.98 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2955  O-methyltransferase family 2  28.31 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.108248 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  26.45 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1991  hypothetical protein  28.34 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059131  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.8 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  24.4 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>