172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0115 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  100 
 
 
338 aa  697    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  79.53 
 
 
339 aa  568  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  77.74 
 
 
339 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  75.37 
 
 
339 aa  532  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  73.89 
 
 
339 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  72.7 
 
 
339 aa  520  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  68.55 
 
 
339 aa  507  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  69.14 
 
 
339 aa  501  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  47.48 
 
 
354 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  28.07 
 
 
344 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  26.57 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  26.57 
 
 
373 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  30.46 
 
 
630 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  25.16 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  29.74 
 
 
630 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  24.62 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  25 
 
 
335 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  23.62 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  26.1 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.61 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.82 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.1 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  26.02 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  27.52 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  23.17 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  29.84 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  30.25 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  25.08 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  26.5 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  26.22 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  22.35 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.23 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  23.7 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  25.38 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  25 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  19.6 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  25.86 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  24.51 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  19.6 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  19.6 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  19.6 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  19.94 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  32.46 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  27.65 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  19.6 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  19.6 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  19.6 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  19.61 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5675  Methyltransferase type 12  27.4 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196275  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.46 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  19.61 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  19.61 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2399  O-methyltransferase  24.84 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  19.61 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  19.61 
 
 
367 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  33.33 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  23.37 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  23.53 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  21.97 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.96 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2658  O-methyltransferase family 2  24.77 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  19.61 
 
 
473 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  21.8 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  21.8 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  29.41 
 
 
353 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  23.38 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  29.49 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  22.13 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  25.16 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  25 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  22.94 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  26.75 
 
 
380 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.58 
 
 
396 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  22.86 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  25.44 
 
 
352 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  26.5 
 
 
336 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1315  O-methyltransferase family protein  22.78 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.575705  normal  0.038188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  23.05 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  25 
 
 
337 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  21.19 
 
 
331 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  22.3 
 
 
392 aa  59.7  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  22.01 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2124  O-methyltransferase family protein  21.38 
 
 
371 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  23.61 
 
 
411 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  22.11 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  21.17 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  23.23 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  19.49 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  21.8 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  25.68 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  27.39 
 
 
360 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  25.41 
 
 
353 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2955  O-methyltransferase family 2  23.55 
 
 
385 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.108248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.81 
 
 
336 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  25.85 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  26.73 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  22.54 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4167  O-methyltransferase family protein  28.91 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116643  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1625  O-methyltransferase family protein  22.03 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  30.97 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>