71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2384 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  100 
 
 		 355 aa  738    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  70.87 
 
 		 360 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  71.99 
 
 		 357 aa  535  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  69.47 
 
 		 357 aa  534  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  68.91 
 
 		 359 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  67.51 
 
 		 363 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  66.39 
 
 		 357 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  66.95 
 
 		 357 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  66.95 
 
 		 357 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  67.23 
 
 		 357 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  66.11 
 
 		 359 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  66.67 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  66.67 
 
 		 357 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  58.89 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  53.74 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  50.72 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  51.01 
 
 		 354 aa  362  5.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  50 
 
 		 379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  49.71 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  48.57 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  46.63 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  45.94 
 
 		 356 aa  345  8.999999999999999e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  47.86 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  47.85 
 
 		 352 aa  322  7e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  30.19 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  33.33 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  28.74 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  25.16 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  23.02 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  22.1 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  23.71 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  26.35 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  22.59 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  24.84 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  24.15 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  24.69 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  28.06 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  24.54 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  26.28 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  23.32 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  25.55 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  28.3 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  24.36 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  25.21 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  25.74 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  26.19 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  23.49 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  30.69 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  24.17 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  24.84 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  25.66 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  26.85 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1625  O-methyltransferase family protein  31.53 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  23.51 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  22.88 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  24.79 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.17 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  24.81 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  26.61 
 
 		 630 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  28.04 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  23.49 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  20.78 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.74 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.44 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  26.61 
 
 		 630 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.17 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  22.81 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.17 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  21.75 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  20.71 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  26.63 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>