114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1505 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  100 
 
 
359 aa  746    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  60.66 
 
 
357 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  60.66 
 
 
357 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  59.83 
 
 
357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  60.66 
 
 
357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  59.83 
 
 
357 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  59.83 
 
 
363 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  59.83 
 
 
357 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  59.56 
 
 
359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  59.83 
 
 
359 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  58.73 
 
 
357 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  58.45 
 
 
360 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  58.89 
 
 
355 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  56.51 
 
 
357 aa  421  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  50.28 
 
 
352 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  50.99 
 
 
354 aa  358  7e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  50.71 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  49.86 
 
 
355 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  50.86 
 
 
355 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  46.67 
 
 
356 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  45.98 
 
 
355 aa  333  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  44.6 
 
 
365 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  45.89 
 
 
357 aa  312  6.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  44.07 
 
 
352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  28.57 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  28.85 
 
 
359 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  27.43 
 
 
334 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  24.6 
 
 
328 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  26.09 
 
 
334 aa  59.3  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.48 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  23.8 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  25.22 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  29.73 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  25.19 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  26.44 
 
 
368 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  25.77 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  23.55 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  29.1 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  23.72 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  26.45 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  24.59 
 
 
411 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  26.39 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  27.52 
 
 
356 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  27.61 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  31.2 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  25.32 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  24.84 
 
 
336 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  29.91 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  25.88 
 
 
342 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  28.78 
 
 
379 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  26.97 
 
 
338 aa  53.1  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.16 
 
 
363 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.16 
 
 
363 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.16 
 
 
363 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  29.6 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  27.1 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  42.86 
 
 
354 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02609  conserved hypothetical protein  30.57 
 
 
419 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.28 
 
 
334 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2537  O-methyltransferase family 2  28.1 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  27.19 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.45 
 
 
381 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  25.36 
 
 
350 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  31.25 
 
 
335 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.25 
 
 
345 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  21.12 
 
 
373 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.5 
 
 
399 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  27.1 
 
 
630 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.5 
 
 
374 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.57 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.57 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  23.27 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  23.87 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.57 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  25.64 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  22.81 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  26.85 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  26.17 
 
 
630 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  28.29 
 
 
339 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  24.26 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  22.76 
 
 
364 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  27.34 
 
 
379 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.84 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  23.83 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  30.21 
 
 
335 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.34 
 
 
379 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00761  conserved hypothetical protein  33.04 
 
 
413 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00390915  normal  0.692825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  21.62 
 
 
353 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  23.72 
 
 
339 aa  46.2  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3177  O-methyltransferase family 2  25.58 
 
 
348 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392119  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  22.28 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  26.97 
 
 
339 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  20.09 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  26.92 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  24.52 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  21.57 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  21.57 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  21.57 
 
 
367 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  25.28 
 
 
351 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  22.81 
 
 
381 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>