83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2873 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  100 
 
 
360 aa  750    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  81.79 
 
 
357 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  73.95 
 
 
357 aa  577  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  71.71 
 
 
359 aa  548  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  70.87 
 
 
355 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  67.23 
 
 
363 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  66.95 
 
 
357 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  66.95 
 
 
357 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  65.55 
 
 
357 aa  521  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  66.11 
 
 
357 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  65.55 
 
 
357 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  65.83 
 
 
357 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  66.02 
 
 
359 aa  511  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  58.45 
 
 
359 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  52.14 
 
 
355 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  50.57 
 
 
352 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  50.72 
 
 
354 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  48.03 
 
 
355 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  48.55 
 
 
379 aa  358  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  46.22 
 
 
356 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  47.67 
 
 
355 aa  354  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  47.4 
 
 
365 aa  343  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  44.19 
 
 
357 aa  333  3e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  46.99 
 
 
352 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  23.46 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  24.36 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  32.61 
 
 
339 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  24.66 
 
 
334 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  24.31 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  23.81 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  27.39 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  26.67 
 
 
339 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  24.52 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  23.53 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  22.02 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  24.26 
 
 
334 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  22.36 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  21.47 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  21.81 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  25.17 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  24.61 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  21.88 
 
 
378 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  22.73 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  21.03 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  26.17 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  21.69 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  20.33 
 
 
333 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  27.36 
 
 
359 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  28.57 
 
 
341 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.95 
 
 
345 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  26.07 
 
 
252 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  23.21 
 
 
358 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  21.79 
 
 
337 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  20.94 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.52 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  27.1 
 
 
630 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  21.94 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  28.18 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  23.58 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  21.81 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  24.84 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  22.19 
 
 
351 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  18.52 
 
 
473 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  18.52 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  18.52 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1070  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  40.98 
 
 
243 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  18.6 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  18.06 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  18.52 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  25.23 
 
 
630 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  18.52 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  23.91 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  25.15 
 
 
387 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  27.1 
 
 
344 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  20.82 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  22.49 
 
 
335 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  20.82 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  20.82 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  25.45 
 
 
337 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  22.54 
 
 
350 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1418  Methyltransferase type 12  31.17 
 
 
328 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  22.95 
 
 
353 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>