86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004060 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 355 aa  742    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  71.92 
 
 		 379 aa  547  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  53.14 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  51.59 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  51.87 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  49.71 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  49.42 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  49.42 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  49.13 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  48 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  49.42 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  49.71 
 
 		 363 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  49.13 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  49.13 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  46.86 
 
 		 359 aa  355  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  46.51 
 
 		 355 aa  355  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  47.67 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  47.67 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  49.86 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  50.87 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  48.57 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  46.78 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  44.7 
 
 		 365 aa  325  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  43.71 
 
 		 357 aa  318  7.999999999999999e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  23.75 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  25.08 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  27.51 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  24.18 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  28.16 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  28.25 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  25.33 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  24.9 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  23.03 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  23.89 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  24 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  21.54 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  22.36 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  26.82 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  24.9 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  22.74 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  25.86 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  24.7 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  26.17 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  27.54 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  22.91 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  22.98 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  24.59 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  25.32 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  23.56 
 
 		 342 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.29 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  21.88 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  25.12 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  24.56 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  20.96 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  25.15 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  21.61 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  24.09 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  20.71 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  22.78 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  23.47 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  23.46 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.08 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.68 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  24.62 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  23.38 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  22.75 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  22.78 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6864  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  21.97 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  23.75 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  24.68 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  21.66 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1280  O-methyltransferase family protein, putative  21.69 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149461  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  24 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  20.95 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.75 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  19.93 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  22.71 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.47 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2708  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.65 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0086  putative O-methyltransferase  21.08 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.58 
 
 		 362 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.346965 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1326  modification methylase, HemK family  30.65 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.695473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.58 
 
 		 362 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2487  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.65 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0920216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2482  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.65 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  21.62 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>