105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0717 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  100 
 
 
365 aa  761    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  47.44 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  48.01 
 
 
357 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  47.85 
 
 
357 aa  352  7e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  49.71 
 
 
355 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  47.73 
 
 
357 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  47.73 
 
 
357 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  48.84 
 
 
357 aa  348  6e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  47.29 
 
 
359 aa  346  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  51.76 
 
 
357 aa  347  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  47.4 
 
 
360 aa  343  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  45.45 
 
 
359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  45.89 
 
 
379 aa  335  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  45.87 
 
 
357 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  45.87 
 
 
357 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  45.87 
 
 
363 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  46.53 
 
 
357 aa  331  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  43.87 
 
 
356 aa  330  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  44.7 
 
 
355 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  45.14 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  44.6 
 
 
359 aa  317  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  45.35 
 
 
352 aa  316  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  45.43 
 
 
352 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  46 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  25.28 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  25.64 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  27.52 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  21.86 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  24.54 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  25.32 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  23.67 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  24.5 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  23.77 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  23.18 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  28.68 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  21.9 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  24.16 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  27.39 
 
 
334 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  24.63 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  26.47 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  22.62 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.71 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  26.57 
 
 
364 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.51 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  22.4 
 
 
379 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.81 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  24 
 
 
330 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  26.28 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  24.02 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.05 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  20.5 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  21.02 
 
 
352 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  20.47 
 
 
353 aa  53.5  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  21.33 
 
 
380 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  22.78 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3515  hydroxyneurosporene methyltransferase  23.08 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1007  O-methyltransferase family 2  26.84 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000712761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1064  O-methyltransferase family 2  24.14 
 
 
368 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  23.26 
 
 
344 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  21.4 
 
 
351 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  21.51 
 
 
329 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  22.41 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  23.05 
 
 
353 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  23.38 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  26.2 
 
 
332 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  24.4 
 
 
345 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  19.44 
 
 
344 aa  49.3  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  23.08 
 
 
339 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  22.75 
 
 
375 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  23.29 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  21.62 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  21.32 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  31.25 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  21.45 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  21.93 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  19.37 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  19.88 
 
 
473 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  19.88 
 
 
338 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  19.88 
 
 
338 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  21.88 
 
 
381 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  19.88 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  23.63 
 
 
392 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  19.88 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  19.88 
 
 
367 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0086  putative O-methyltransferase  26.06 
 
 
350 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  22.49 
 
 
342 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2955  O-methyltransferase family 2  23.08 
 
 
385 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.108248 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  24.77 
 
 
630 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  24.77 
 
 
630 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  21.79 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1280  O-methyltransferase family protein, putative  25.45 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  23.08 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  25 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  23.33 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  21.7 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  21.65 
 
 
339 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1589  O-methyltransferase  25.45 
 
 
350 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1506  O-methyltransferase  25.45 
 
 
350 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  22.19 
 
 
359 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  20.9 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.513829 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>