137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3515 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3515  hydroxyneurosporene methyltransferase  100 
 
 
376 aa  760    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  57.81 
 
 
378 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  55.25 
 
 
379 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  54.97 
 
 
379 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  53.65 
 
 
379 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  43.97 
 
 
381 aa  262  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  46.39 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  43.09 
 
 
380 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  43.21 
 
 
380 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2955  O-methyltransferase family 2  44.12 
 
 
385 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.108248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  42.38 
 
 
373 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  43.42 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2728  O-methyltransferase family protein  43.05 
 
 
381 aa  242  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  41.85 
 
 
377 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  41.16 
 
 
381 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  41.35 
 
 
396 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  39.19 
 
 
381 aa  209  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3695  O-methyltransferase family protein  43.29 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.79 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.79 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.79 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  35.89 
 
 
338 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.91 
 
 
362 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.91 
 
 
362 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.91 
 
 
362 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  30.88 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  33.97 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2460  O-methyltransferase family protein  29.52 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.507965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  29.04 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  30.49 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.03 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.94 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  29.88 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  25.75 
 
 
331 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  28.66 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  28.06 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3051  O-methyltransferase family 2  29.91 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  27.65 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.28 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.67 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  29.48 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  23.51 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  26.53 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  27.62 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.94 
 
 
399 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.87 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  25.95 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  24.52 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  26.73 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  31.21 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  27.47 
 
 
345 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  34.84 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  27.38 
 
 
334 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  26.39 
 
 
333 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  30.43 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  26.04 
 
 
339 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.74 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3177  O-methyltransferase family 2  33.52 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  28.9 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  28.12 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  32.64 
 
 
353 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  29.34 
 
 
554 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  25.56 
 
 
361 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  25.38 
 
 
473 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  24.78 
 
 
344 aa  59.7  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  23.83 
 
 
630 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  26.65 
 
 
337 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  26.65 
 
 
337 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  26.65 
 
 
337 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  26.65 
 
 
337 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  26.65 
 
 
337 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  26.65 
 
 
337 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  25.45 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  23.83 
 
 
630 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  26.65 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  25.3 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  25.45 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  25.3 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  25.45 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.19 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.37 
 
 
336 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  23.35 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  29.9 
 
 
363 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  28.77 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  35.14 
 
 
337 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1927  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.89 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.754339  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  26.91 
 
 
359 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  28.65 
 
 
352 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  30.19 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  26.59 
 
 
354 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  28.96 
 
 
336 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  20.75 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06952  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 
494 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.216189  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  23.7 
 
 
338 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  31.07 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  25.27 
 
 
353 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  28.48 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  28.34 
 
 
332 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  29.38 
 
 
346 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  23.61 
 
 
339 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>