177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3079 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  100 
 
 
354 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  33.44 
 
 
331 aa  162  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  29.22 
 
 
337 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.79 
 
 
362 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.31 
 
 
363 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.79 
 
 
362 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.31 
 
 
363 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.31 
 
 
363 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.46 
 
 
362 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  33.01 
 
 
374 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  33.01 
 
 
399 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  40.09 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  32.51 
 
 
342 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.78 
 
 
384 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  33.65 
 
 
344 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  33.01 
 
 
334 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.4 
 
 
337 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  33.23 
 
 
375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  32.27 
 
 
336 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  31.96 
 
 
354 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  29.55 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  31.56 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  30.86 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  30.67 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  30.67 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  30.24 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  34.59 
 
 
337 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.41 
 
 
334 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  30.77 
 
 
341 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3051  O-methyltransferase family 2  36.75 
 
 
324 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.1 
 
 
336 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2460  O-methyltransferase family protein  31.33 
 
 
363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.507965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  34.22 
 
 
330 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.27 
 
 
345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1927  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.86 
 
 
343 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.754339  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  29.61 
 
 
345 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  29.8 
 
 
387 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2830  O-methyltransferase family protein  33.76 
 
 
339 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.585064  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  28.79 
 
 
380 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  29.41 
 
 
380 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2671  O-methyltransferase family 2  36.13 
 
 
671 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2537  O-methyltransferase family 2  33.58 
 
 
339 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.19 
 
 
378 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  38.33 
 
 
363 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  30.23 
 
 
352 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  30.94 
 
 
381 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5070  O-methyltransferase family 2  26.58 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.88726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  29.19 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0838  O-methyltransferase family 2  25.97 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  30.25 
 
 
381 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  37.27 
 
 
334 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6864  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.12 
 
 
340 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  28.68 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  28.25 
 
 
377 aa  90.1  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3177  O-methyltransferase family 2  31.42 
 
 
348 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392119  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14480  O-methyltransferase  30.23 
 
 
345 aa  89.7  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.31 
 
 
379 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  30.28 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  28.31 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  29.35 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.81 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2214  O-methyltransferase family protein  32.9 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  28.27 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  28.16 
 
 
554 aa  83.2  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  27.31 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  27.6 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  27.01 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  28.96 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  32.6 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  26.37 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  27.01 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2955  O-methyltransferase family 2  29.19 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.108248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  23.86 
 
 
353 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  25.94 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  29.64 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  30.32 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2170  O-methyltransferase family protein  30.69 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3515  hydroxyneurosporene methyltransferase  27.65 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758284 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  30.47 
 
 
630 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  31.25 
 
 
630 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  27.27 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2728  O-methyltransferase family protein  29.27 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  30 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  26.72 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  27.41 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2399  O-methyltransferase  24.28 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  27.97 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  26.94 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  28.83 
 
 
339 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2658  O-methyltransferase family 2  24.63 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00761  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00390915  normal  0.692825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.18 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  28.91 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  22.59 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  25.88 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1625  O-methyltransferase family protein  27.34 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  21.99 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3695  O-methyltransferase family protein  29.17 
 
 
392 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0859  QbsJ-like methyltransferase  26.57 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.226018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>